RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474929.1

USP54-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 4

Gene USP54, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-211ENST00000474929 FBP1P09467 338 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 PF4V1P10720 104 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 MAKP20794 623 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 KIR2DS4P43632 304 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 ATP12AP54707 1039 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 CAMK2DQ13557 499 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 LRIG3Q6UXM1 1119 aa6.7□□□□□ -1.34
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USP54-211ENST00000474929 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 DDIASQ8IXT1 998 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.7□□□□□ -1.34
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USP54-211ENST00000474929 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.7□□□□□ -1.34
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USP54-211ENST00000474929 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.7□□□□□ -1.34
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USP54-211ENST00000474929 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 CACNG2Q9Y698 323 aa6.7□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 IFNL4K9M1U5 179 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 ZNF208O43345 1280 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 SLC43A1O75387 559 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 UBL3O95164 117 aa6.69□□□□□ -1.34
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USP54-211ENST00000474929 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 CD79AP11912 226 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 KRTAP10-11P60412 298 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 FGF12P61328 243 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 NIPAL3Q6P499 406 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 ZAR1Q86SH2 424 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 GPAT4Q86UL3 456 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 SATL1Q86VE3 508 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 ZNF563Q8TA94 476 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 MAGEB18Q96M61 343 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 MIOXQ9UGB7 285 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 PSAT1Q9Y617 370 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 FBP2O00757 339 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 PHYHO14832 338 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP54-211ENST00000474929 OTCP00480 354 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 IGHV1-69P01742 117 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 IGHV3-13P01766 116 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP54-211ENST00000474929 UROSP10746 265 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP54-211ENST00000474929 TNFRSF1AP19438 455 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP54-211ENST00000474929 KCNJ1P48048 391 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 SELENOPP49908 381 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 PRKAG1P54619 331 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP54-211ENST00000474929 SKP2Q13309 424 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 PMS2P3Q13401 168 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 DUSP5Q16690 384 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 PFKFB4Q16877 469 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 CCNJQ5T5M9 372 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 TMEM225Q6GV28 225 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 CDC73Q6P1J9 531 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 ISCA2Q86U28 154 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 PDIK1LQ8N165 341 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-211ENST00000474929 NSMAFQ92636 917 aa6.68□□□□□ -1.34
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