RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474346.1

TNS3-211, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TNS3, Length 775 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-211ENST00000474346 TRIP10Q15642 601 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 C1orf140Q5VVS0 124 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 EPHX4Q8IUS5 362 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 MFSD8Q8NHS3 518 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 RDH5Q92781 318 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 TEX37Q96LM6 180 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 OR52B2Q96RD2 323 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 NELFAQ9H3P2 528 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 CALML5Q9NZT1 146 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 BTNL2Q9UIR0 455 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 A0A096LPE4 126 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 A0A1W2PPZ6 126 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 CDHR4A6H8M9 788 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 UPK3AO75631 287 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 AHSA1O95433 338 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 SAGP10523 405 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 NR2F1P10589 423 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 ZNF43P17038 809 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 LBPP18428 481 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 NR4A1P22736 598 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 ARFIP2P53365 341 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 RPS23P62266 143 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 TUBA1BP68363 451 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 TUBA4AP68366 448 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 ARF1P84077 181 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 SYPL1Q16563 259 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 MMEL1Q495T6 779 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 LIN52Q52LA3 116 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 NXNQ6DKJ4 435 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 C5orf46Q6UWT4 87 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 TUBA1AQ71U36 451 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 ANKRD46Q86W74 232 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 CDK20Q8IZL9 346 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 GPR137CQ8N3F9 429 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 ANKFN1Q8N957 763 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 PIK3C3Q8NEB9 887 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 CLDND2Q8NHS1 167 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 CCDC115Q96NT0 180 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 ZNF416Q9BWM5 594 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 RACGAP1Q9H0H5 632 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 NOX3Q9HBY0 568 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 CRLF2Q9HC73 371 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 AIG1Q9NVV5 245 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 REV1Q9UBZ9 1251 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 FBXL3Q9UKT7 428 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 NOX1Q9Y5S8 564 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 USH1CQ9Y6N9 552 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS3-211ENST00000474346 TMEM229AB2RXF0 380 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 OR2T1O43869 369 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 NPIPB7O75200 414 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 ZNF432O94892 652 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 PNPP00491 289 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 GSNP06396 782 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 IL12AP29459 219 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 S100A3P33764 101 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 UFM1P61960 85 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 NPRL3Q12980 569 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 OGFOD2Q6N063 350 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 LINGO2Q7L985 606 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 SNX32Q86XE0 403 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 RNF130Q86XS8 419 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 CADM2Q8N3J6 435 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 C7orf26Q96N11 449 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 OXGR1Q96P68 337 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 SUCNR1Q9BXA5 334 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 ZNF385DQ9H6B1 395 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 SEC61A2Q9H9S3 476 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 GPR35Q9HC97 309 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 SLC52A3Q9NQ40 469 aa11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 TRPC5OSA6NMA1 111 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 E9PBE3 544 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 KRT75O95678 551 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 CELA3BP08861 270 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 GAAP10253 952 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 EPHA1P21709 976 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 GLRXP35754 106 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 CAPZA2P47755 286 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 CLDN17P56750 224 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 MYBPC1Q00872 1141 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TNS3-211ENST00000474346 CEACAM16Q2WEN9 425 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms