RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	VEZF1	Q14119	521 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	OR1Q1	Q15612	314 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CCDC80	Q76M96	950 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	NUP37	Q8NFH4	326 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	OR2M2	Q96R28	347 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	RNF223	E7ERA6	249 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CHP2	O43745	196 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CD5L	O43866	347 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC43A1	O75387	559 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CRLF1	O75462	422 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	NPPA	P01160	153 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	IGF2	P01344	180 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CSF3	P09919	207 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	BMP4	P12644	408 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CBR1	P16152	277 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC25A16	P16260	332 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	PCGF2	P35227	344 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	FABP6	P51161	128 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CHRNB3	Q05901	458 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	LGALS3BP	Q08380	585 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	EFNB3	Q15768	340 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	DUSP7	Q16829	419 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	NIPAL3	Q6P499	406 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	PXK	Q7Z7A4	578 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	GPR35	Q9HC97	309 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CUBN	O60494	3623 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	INAFM1	C9JVW0	142 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	ANGPT2	O15123	496 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	SASH3	O75995	380 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	HPR	P00739	348 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CD247	P20963	164 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	EFNA4	P52798	201 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CRYBA2	P53672	197 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CDH12	P55289	794 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CLDN17	P56750	224 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	NAAA	Q02083	359 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	PUDP	Q08623	228 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	ZP4	Q12836	540 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	SELPLG	Q14242	412 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	NPTX1	Q15818	432 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	PROX1	Q92786	737 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM160	Q9NX00	188 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	10.74	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	VWC2L	B2RUY7	222 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307		B9A039	149 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307		M0QX08	132 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	FXYD1	O00168	92 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	FBP2	O00757	339 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	PLPP3	O14495	311 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	KRT33A	O76009	404 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CRYAA	P02489	173 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	THY1	P04216	161 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PGAP2-215	ENST00000469307	CECR9	P0C854	216 aa		10.73	□□□□□ -0.69

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