RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469297.1

CACNA2D1-208, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, human

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 413 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNA2D1-208	ENST00000469297	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FAM131B	Q86XD5	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	COX16	Q9P0S2	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PCM1	Q15154	2024 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297		H3BMH7	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297		K7EQD1	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZNF749	O43361	778 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GMFG	O60234	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TSPAN2	O60636	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SPAG6	O75602	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HPR	P00739	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ADORA3	P0DMS8	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ANOS1	P23352	680 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PTPN6	P29350	595 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FCGR2C	P31995	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ADRA1A	P35348	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ACTR1B	P42025	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PTGFR	P43088	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GNPDA1	P46926	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CSNK1D	P48730	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HCAR3	P49019	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ACTR1A	P61163	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CSNK1G2	P78368	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RIG	Q13278	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TRIP10	Q15642	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PARP15	Q460N3	678 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PHC2	Q8IXK0	858 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ANK2	Q01484	3957 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297		A0A0U1RQS6	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TSPAN11	A1L157	253 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297		G3V2L1	256 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KCNAB3	O43448	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	BUB1	O43683	1085 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SELE	P16581	610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CA5A	P35218	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PCK1	P35558	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TDGF1P3	P51864	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ERVK-16	P61578	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HERVK_113	P63132	956 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ERVK-8	P63133	956 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OGDH	Q02218	1023 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TMEM187	Q14656	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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