RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465905.5

TRAPPC10-206, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 563 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-206ENST00000465905 SONP18583 2426 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 A0A087WUJ7 227 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 A8MV72 311 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 ANGPT2O15123 496 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 TPST1O60507 370 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZNF432O94892 652 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 F12P00748 615 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 AQP1P29972 269 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 SERPINF1P36955 418 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 ARF1P84077 181 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 NAAAQ02083 359 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 RBBP4Q09028 425 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 OR1Q1Q15612 314 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 CYP51A1Q16850 503 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 RUNDC3AQ59EK9 446 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 DLEU7Q6UYE1 221 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 LINGO2Q7L985 606 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 HDXQ7Z353 690 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 C10orf111Q8N326 155 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 C10orf53Q8N6V4 93 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZNF525Q8N782 197 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 SCAIQ8N9R8 606 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 OR4F15Q8NGB8 312 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 PROX1Q92786 737 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 MAGEB18Q96M61 343 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 IKZF5Q9H5V7 419 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 CRLF2Q9HC73 371 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 GPR35Q9HC97 309 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 CA10Q9NS85 328 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 SEC14L4Q9UDX3 406 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 NDUFAF1Q9Y375 327 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 A0A0B4J2E0 115 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 A0A1B0GX12 115 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 B9A039 149 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 PDE5AO76074 875 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 MFN2O95140 757 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 IFNA2P01563 188 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 IGLV1-44P01699 117 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 VIMP08670 466 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 CECR9P0C854 216 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 CBR1P16152 277 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 CBLP22681 906 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 ARR3P36575 388 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 PDLIM4P50479 330 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 TUBA1BP68363 451 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 TUBA4AP68366 448 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 PMS2P3Q13401 168 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 ADRM1Q16186 407 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 SWI5Q1ZZU3 235 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 MST1LQ2TV78 715 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 CEACAM16Q2WEN9 425 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 TMEM249Q2WGJ8 235 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 TUBA1AQ71U36 451 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 DHDDSQ86SQ9 333 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 COMTD1Q86VU5 262 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 SNX32Q86XE0 403 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 SLC30A8Q8IWU4 369 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 DPP10Q8N608 796 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 C10orf105Q8TEF2 133 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 TSPEARQ8WU66 669 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 CKAP2Q8WWK9 683 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 OR2M2Q96R28 347 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 PRR14Q9BWN1 585 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 ADAM21Q9UKJ8 722 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 A0A096LNT2 108 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZNF726A6NNF4 738 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 M0R3G1 203 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 GPRIN2O60269 458 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 FMO6PO60774 539 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 IGKV3-15P01624 115 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 C8BP07358 591 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 OR4A8P0C604 315 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 USF1P22415 310 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 CAPZA2P47755 286 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 VLDLRP98155 873 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 PUDPQ08623 228 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 CHRFAM7AQ494W8 412 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 CARD17Q5XLA6 110 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZNF613Q6PF04 617 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 VHLLQ6RSH7 139 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 HIPK1Q86Z02 1210 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 C20orf196Q8IYI0 205 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 TMEM123Q8N131 208 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 SMYD1Q8NB12 490 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 NUP37Q8NFH4 326 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 IL17RDQ8NFM7 739 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC10-206ENST00000465905 SLC41A3Q96GZ6 507 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms