RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463927.6

TIMMDC1-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene TIMMDC1, Length 670 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-202ENST00000463927 PXKQ7Z7A4 578 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 GPR137CQ8N3F9 429 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 TMEM239Q8WW34 195 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 PRR14Q9BWN1 585 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 NDEL1Q9GZM8 345 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 MUC13Q9H3R2 512 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 RIMS3Q9UJD0 308 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ADAM21Q9UKJ8 722 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.76□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 CCDC168Q8NDH2 2452 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 LYPD3O95274 346 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 WNT11O96014 354 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 CD3EP07766 207 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ITGA5P08648 1049 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ADORA3P0DMS8 318 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ITGA2P17301 1181 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 TNFRSF1BP20333 461 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 AHCYP23526 432 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 EDNRAP25101 427 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 SELENOPP49908 381 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 TRAM2Q15035 370 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 MTX3Q5HYI7 312 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 P3H2Q8IVL5 708 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 DEFB107AQ8IZN7 70 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 FITM2Q8N6M3 262 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 MBD6Q96DN6 1003 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 SGTBQ96EQ0 304 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 BOD1Q96IK1 185 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 RADILQ96JH8 1075 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 NSMCE2Q96MF7 247 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 MOGAT1Q96PD6 335 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 FNDC11Q9BVV2 318 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 GORASP2Q9H8Y8 452 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 MGAT4BQ9UQ53 548 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 POLQO75417 2590 aa8.75□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 SPG11Q96JI7 2443 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 NPIPB13A6NJU9 1138 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ZNF726A6NNF4 738 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 POM121CA8CG34 1229 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 NPIPB4C9JG80 1138 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 PLPP3O14495 311 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 SIAH2O43255 324 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 RNF13O43567 381 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 OR7A10O76100 309 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ZNF432O94892 652 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 STAMBPO95630 424 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 CH25HO95992 272 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 THY1P04216 161 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ASAH2BP0C7U1 165 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 PTNP21246 168 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 CBLP22681 906 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 PTAFRP25105 342 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 DAP3P51398 398 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 UGT2B15P54855 530 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ZP4Q12836 540 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 TAF11Q15544 211 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 TSC22D1Q15714 1073 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 GABRA6Q16445 453 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 GLYATQ6IB77 296 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 TMEM123Q8N131 208 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 BCAS4Q8TDM0 211 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 TMEM255BQ8WV15 326 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 LIPHQ8WWY8 451 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 PIGTQ969N2 578 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 MCUR1Q96AQ8 359 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 LRR1Q96L50 414 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 MUS81Q96NY9 551 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 OR2M2Q96R28 347 aa8.74□□□□□ -1.01
TIMMDC1-202ENST00000463927 FOXC2Q99958 501 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms