RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM160Q9NX00 188 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 RCE1Q9Y256 329 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC35F4A4IF30 521 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 AIM2O14862 343 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 TPST1O60507 370 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 LMX1BO60663 402 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 SEC14L2O76054 403 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 HPRP00739 348 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 IGLV1-44P01699 117 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 ETS2P15036 469 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 CBR1P16152 277 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 PAX7P23759 505 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 IGFBP5P24593 272 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 PRKAR1BP31321 381 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 THBS4P35443 961 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 CAPZA2P47755 286 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 STX1BP61266 288 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 EFNB3Q15768 340 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 IQCCQ4KMZ1 466 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 CARD17Q5XLA6 110 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 REEP3Q6NUK4 255 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 C6orf89Q6UWU4 347 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 MDP1Q86V88 176 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 FUNDC1Q8IVP5 155 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 OR4F15Q8NGB8 312 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF217Q8TC41 542 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC38A4Q969I6 547 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 OR2M2Q96R28 347 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 PLK3Q9H4B4 646 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 TMBIM4Q9HC24 238 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 CRLF2Q9HC73 371 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 hCG_2039718K7EN88 272 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 M0R3G1 203 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 NDUFS8O00217 210 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 OR2T1O43869 369 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 FZD7O75084 574 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 PDE5AO76074 875 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 IGKV3-15P01624 115 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 ARAFP10398 606 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 NQO1P15559 274 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 NPR2P20594 1047 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 AQP1P29972 269 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 IDH3AP50213 366 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 CDK6Q00534 326 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 NPRL3Q12980 569 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 ALG10BQ5I7T1 473 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 PAGE3Q5JUK9 113 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 LRIF1Q5T3J3 769 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM69AQ5T7M9 428 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM166AQ6J272 317 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT73Q86Y46 540 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 UEVLDQ8IX04 471 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM123Q8N131 208 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 SVOPLQ8N434 492 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 PIK3C3Q8NEB9 887 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 NUP37Q8NFH4 326 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 SPDL1Q96EA4 605 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 EBF4Q9BQW3 602 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 C12orf10Q9HB07 376 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 SELENONQ9NZV5 590 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A087WUJ7 227 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-206ENST00000446904 VSTM5A8MXK1 200 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms