RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 VCX3BQ9H321 246 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CTPS2Q9NRF8 586 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 RHCGQ9UBD6 479 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 PLCE1Q9P212 2302 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 A0A1B0GWA3 101 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 G3V2T6 193 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 H0YJX3 145 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 C16orf97H3BN30 126 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 H3BNH8 94 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 NDUFB5O43674 189 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SSX4O60224 188 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TGM6O95932 706 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 DANCRP0C864 163 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 THRBP10828 461 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 POU2F1P14859 743 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CBLP22681 906 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 RBMXP38159 391 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ALDH3A2P51648 485 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TAS2R41P59536 307 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SRYQ05066 204 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SEC23BQ15437 767 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 OR1Q1Q15612 314 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 BEX5Q5H9J7 111 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF613Q6PF04 617 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 STK32CQ86UX6 486 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 OR10G2Q8NGC3 310 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 WNT2BQ93097 391 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF524Q96C55 264 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 UCN2Q96RP3 112 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF426Q9BUY5 554 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CNIH4Q9P003 139 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 C7orf72A4D263 438 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TP53I11O14683 189 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CHP2O43745 196 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ALX3O95076 343 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 NTN1O95631 604 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CPN1P15169 458 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CASP3P42574 277 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SLC6A8P48029 635 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SMIM11AP58511 58 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ST3GAL3Q11203 375 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 FAPQ12884 760 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SNTA1Q13424 505 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TRAM2Q15035 370 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TOMM20Q15388 145 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 MICAQ29983 383 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 FGD3Q5JSP0 725 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 OR9Q2Q8NGE9 314 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 OR52J3Q8NH60 311 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 C3orf49Q96BT1 292 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 FNDC11Q9BVV2 318 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TRIM2Q9C040 744 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 VCXQ9H320 206 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SLC7A7Q9UM01 511 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 A0A087WUU8 490 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 HCRTR2O43614 444 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CYP7B1O75881 506 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CCNB2O95067 398 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms