RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 ENPP1P22413 925 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 SLC35A1P78382 337 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 HBMQ6B0K9 141 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 VASNQ6EMK4 673 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 SIAH3Q8IW03 269 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 WDFY1Q8IWB7 410 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 OR4K13Q8NH42 304 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 OR10D3Q8NH80 312 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 SGCDQ92629 289 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 TSPAN32Q96QS1 320 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 RHNO1Q9BSD3 238 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 CXCL13O43927 109 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 HMGN1P05114 100 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 ZNF708P17019 499 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 NUDT6P53370 316 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 CARD18P57730 90 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 PLXDC2Q6UX71 529 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 GHDCQ8N2G8 530 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 SLC43A2Q8N370 569 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 CYB561A3Q8NBI2 242 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 OR2V1Q8NHB1 315 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 HCAR1Q9BXC0 346 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 MED20Q9H944 212 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 CMC2Q9NRP2 79 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 INIPQ9NRY2 104 aa20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 TMEM8BA6NDV4 472 aa20.82■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 ARPC3O15145 178 aa20.82■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 ENTPD6O75354 484 aa20.82■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 LYNP07948 512 aa20.82■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 ZP4Q12836 540 aa20.82■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 PAQR6Q6TCH4 344 aa20.82■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 OR52E2Q8NGJ4 325 aa20.82■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 TMEM163Q8TC26 289 aa20.82■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 ZPLD1Q8TCW7 415 aa20.82■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 LRR1Q96L50 414 aa20.82■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 TIMP4Q99727 224 aa20.82■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 PRORYQ9H606 182 aa20.82■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 EXO5Q9H790 373 aa20.82■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 AQP7P3A6NL99 342 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 NPIPA5E9PKD4 350 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 IGHG3P01860 377 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 RAC3P60763 192 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 ACKR1Q16570 336 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 NHLRC1Q6VVB1 395 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 FAM26EQ8N5C1 309 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 Q8NA96 180 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 BBS1Q8NFJ9 593 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 KLHL13Q9P2N7 655 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 NPIPA1Q9UND3 350 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 BAIAP2Q9UQB8 552 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 HSF1Q00613 529 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 CRMP1Q14194 572 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 GPAT4Q86UL3 456 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 CPOQ8IVL8 374 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 SDR9C7Q8NEX9 313 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 TXNDC15Q96J42 360 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 PLEKHA8Q96JA3 519 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 TEX12Q9BXU0 123 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 SLC1A7O00341 560 aa20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 SDHAP31040 664 aa20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 TMEM225Q6GV28 225 aa20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 EXD3Q8N9H8 876 aa20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 ROBO4Q8WZ75 1007 aa20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 PTP4A1Q93096 173 aa20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 NMNAT3Q96T66 252 aa20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 GRHPRQ9UBQ7 328 aa20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 ATRXP46100 2492 aa20.8■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 MPZL2O60487 215 aa20.79■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 ACTL6AO96019 429 aa20.79■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 IFNGR1P15260 489 aa20.79■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 CRHBPP24387 322 aa20.79■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 ITGADQ13349 1161 aa20.79■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 MELKQ14680 651 aa20.79■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 MESTQ5EB52 335 aa20.79■□□□□ 0.92
CNN3-202ENST00000394202 PLBD1Q6P4A8 553 aa20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms