RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373920.6

PSMD5-204, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 5, human

TSL 5

Gene PSMD5, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD5-204	ENST00000373920	KDM8	Q8N371	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	ATR	Q13535	2644 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920		A0A1B0GWA3	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920		M0QX08	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920		M0R1B8	84 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	ABCD4	O14678	606 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	KRT34	O76011	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	AHSA1	O95433	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	OPN1SW	P03999	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	INHBB	P09529	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	ETS2	P15036	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	GPX2	P18283	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	HTR2A	P28223	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	MAP2K6	P52564	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	ARFIP2	P53365	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	SLC16A1	P53985	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	ATP5J2	P56134	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	H3F3A	P84243	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	TGFBR3	Q03167	851 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	DMTN	Q08495	405 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	SELPLG	Q14242	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	ADRM1	Q16186	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	NIPAL3	Q6P499	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	COMTD1	Q86VU5	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	OR10A6	Q8NH74	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920		Q96MF0	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	CGREF1	Q99674	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	SMR3A	Q99954	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMD5-204	ENST00000373920	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms