RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 PRAMEF4O60810 478 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ETV6P41212 452 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GSK3AP49840 483 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 FABP6P51161 128 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 RAB11AP62491 216 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OR6V1Q8N148 313 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ARV1Q9H2C2 271 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 NRIP3Q9NQ35 241 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TREX1Q9NSU2 369 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 H0YGG7 62 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CDONQ4KMG0 1287 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 NGBQ9NPG2 151 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 G3V3Y1 287 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TXNDC12O95881 172 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 AOAHP28039 575 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PRLHRP49683 370 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 MFAP5Q13361 173 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 Q6ZTK2 550 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 NANPQ8TBE9 248 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CALHM2Q9HA72 323 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CXCL12P48061 93 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SLC6A11P48066 632 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 NDUFA6P56556 154 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SIRPAP78324 504 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OR8B8Q15620 311 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TBPL2Q6SJ96 375 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GHSRQ92847 366 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GJB3O75712 270 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CASP3P42574 277 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 UBE2G2P60604 165 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ASB11Q8WXH4 323 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 EMCNQ9ULC0 261 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 P2RY10O00398 339 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SHC1P29353 583 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TMEM106AQ96A25 262 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GINS3Q9BRX5 216 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.9□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 DRGXA6NNA5 263 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SCRG1O75711 98 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 RPE65Q16518 533 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 ENTHD1Q8IYW4 607 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 EID2Q8N6I1 236 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 PMP2P02689 132 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 CNR1P21554 472 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 CD38P28907 300 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 EDDM3BP56851 147 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 OPA3Q9H6K4 179 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SLC1A3P43003 542 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 GABRA4P48169 554 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 HMGN3Q15651 99 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 ADIRFQ15847 76 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 HBMQ6B0K9 141 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 MFSD9Q8NBP5 474 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 LHX6Q9UPM6 363 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 SIGLEC6O43699 453 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 NXPH2O95156 264 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 NMNAT3Q96T66 252 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 GDE1Q9NZC3 331 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.89□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 M0QYG6 137 aa14.88□□□□□ -0.03
RXRA-201ENST00000356384 TIMP1P01033 207 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms