RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 SLC17A1Q14916 467 aa24.77■■□□□ 1.56
GIPC1-201ENST00000345425 RFX4Q33E94 735 aa24.77■■□□□ 1.56
GIPC1-201ENST00000345425 OR2A2Q6IF42 318 aa24.77■■□□□ 1.56
GIPC1-201ENST00000345425 C3P1Q6ZMU1 363 aa24.77■■□□□ 1.56
GIPC1-201ENST00000345425 UEVLDQ8IX04 471 aa24.77■■□□□ 1.56
GIPC1-201ENST00000345425 KDM8Q8N371 416 aa24.77■■□□□ 1.56
GIPC1-201ENST00000345425 OR52L1Q8NGH7 329 aa24.77■■□□□ 1.56
GIPC1-201ENST00000345425 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
GIPC1-201ENST00000345425 VCX3BQ9H321 246 aa24.77■■□□□ 1.56
GIPC1-201ENST00000345425 GP6Q9HCN6 339 aa24.77■■□□□ 1.56
GIPC1-201ENST00000345425 INIPQ9NRY2 104 aa24.77■■□□□ 1.56
GIPC1-201ENST00000345425 B3GAT1Q9P2W7 334 aa24.77■■□□□ 1.56
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GIPC1-201ENST00000345425 H3BN98 237 aa24.76■■□□□ 1.55
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GIPC1-201ENST00000345425 EMC3Q9P0I2 261 aa24.76■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa24.75■■□□□ 1.55
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GIPC1-201ENST00000345425 SLC6A6P31641 620 aa24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 TIMP3P35625 211 aa24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 SLC36A3Q495N2 470 aa24.75■■□□□ 1.55
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GIPC1-201ENST00000345425 TEX47Q8TBZ9 253 aa24.75■■□□□ 1.55
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GIPC1-201ENST00000345425 TBC1D23Q9NUY8 699 aa24.75■■□□□ 1.55
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GIPC1-201ENST00000345425 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 E9PLN8 166 aa24.75■■□□□ 1.55
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GIPC1-201ENST00000345425 TP53P04637 393 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 F13BP05160 661 aa24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 ESRRGP62508 458 aa24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 IGFBP7Q16270 282 aa24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 C9orf106Q8NAJ2 232 aa24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 SAMD8Q96LT4 415 aa24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 ZFP3Q96NJ6 502 aa24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 VKORC1Q9BQB6 163 aa24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
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GIPC1-201ENST00000345425 BCO1Q9HAY6 547 aa24.75■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 CFAP46Q8IYW2 2715 aa24.74■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PRG6 482 aa24.74■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 MITFO75030 526 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 IL2RAP01589 272 aa24.74■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 THSD4Q6ZMP0 1018 aa24.74■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa24.74■■□□□ 1.55
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GIPC1-201ENST00000345425 LRRC75AQ8NAA5 344 aa24.74■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 NRG4Q8WWG1 115 aa24.74■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 IL20RAQ9UHF4 553 aa24.74■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 POLEQ07864 2286 aa24.74■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF724A8MTY0 619 aa24.73■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 MCIDASD6RGH6 385 aa24.73■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 SERPINI2O75830 405 aa24.73■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 PER3P56645 1201 aa24.73■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 CTXN1P60606 82 aa24.73■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM211Q6ICI0 200 aa24.73■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 SEM1Q6ZVN7 128 aa24.73■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 RPRMLQ8N4K4 120 aa24.73■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa24.73■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 CD14P08571 375 aa24.72■■□□□ 1.55
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GIPC1-201ENST00000345425 CREB3L2Q70SY1 520 aa24.72■■□□□ 1.55
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GIPC1-201ENST00000345425 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa24.72■■□□□ 1.55
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GIPC1-201ENST00000345425 GLI4P10075 376 aa24.72■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 POU1F1P28069 291 aa24.72■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 CRISP1P54107 249 aa24.72■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa24.72■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 KATNB1Q9BVA0 655 aa24.72■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 TSSK6Q9BXA6 273 aa24.72■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 GABARAPL3Q9BY60 117 aa24.72■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 ENKD1Q9H0I2 346 aa24.72■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 NRIP3Q9NQ35 241 aa24.72■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 MEMO1Q9Y316 297 aa24.72■■□□□ 1.55
GIPC1-201ENST00000345425 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
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