RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290378.4

ACTC1-201, Transcript of actin, alpha, cardiac muscle 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTC1, Length 4,106 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1-201ENST00000290378 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 SCGB1D2O95969 90 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 LGI1O95970 557 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 TSPAN31Q12999 210 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 TMEM44Q2T9K0 475 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 PMM1Q92871 262 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF75AQ96N20 296 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 FAM83CQ9BQN1 747 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 ASXL3Q9C0F0 2248 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 SLC22A31A6NKX4 558 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 H0YIV9 168 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 B3GALT2O43825 422 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 SLCO2B1O94956 709 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 ATP1B1P05026 303 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 CRYBA1P05813 215 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 TBXA2RP21731 343 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 G0S2P27469 103 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 SLC6A12P48065 614 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 CDNFQ49AH0 187 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 PLA1AQ53H76 456 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 TMEM196Q5HYL7 178 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 RASGRP3Q8IV61 690 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 SUN3Q8TAQ9 357 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 ST7LQ8TDW4 575 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 LURAP1Q96LR2 239 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 SMIM3Q9BZL3 60 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 ZSCAN32Q9NX65 697 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 FPR3P25089 353 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 SERTAD2Q14140 314 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 GUCA2BQ16661 112 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 C12orf73Q69YU5 71 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 TMEM71Q6P5X7 295 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 Q6ZS52 159 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 LINC00471Q8N535 108 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 OR6N2Q8NGY6 317 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 OR4Q3Q8NH05 313 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 PFN4Q8NHR9 129 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 YIPF5Q969M3 257 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 TBC1D20Q96BZ9 403 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 CMKLR1Q99788 373 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 BRF2Q9HAW0 419 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 CTSFQ9UBX1 484 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 GREB1Q4ZG55 1949 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 MCRIP1C9JLW8 97 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 HTR3BO95264 441 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 SFTPBP07988 381 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 PTAFRP25105 342 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 CD34P28906 385 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 GUCA2AQ02747 115 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 GGTA1PQ4G0N0 100 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 MANEAQ5SRI9 462 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 CRIPAKQ8N1N5 446 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 SLC25A36Q96CQ1 311 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 SCMH1Q96GD3 660 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 A4GNTQ9UNA3 340 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 OR6C68A6NDL8 312 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 IDSB3KWA1 339 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 OR8G3PP0DMU2 310 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 NME1P15531 152 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 TAS2R38P59533 333 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF616Q08AN1 781 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 FABP9Q0Z7S8 132 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 JAZF1Q86VZ6 243 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 STEAP2Q8NFT2 490 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 UBTD2Q8WUN7 234 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 DCUN1D4Q92564 292 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 FAM46BQ96A09 425 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 PEX11GQ96HA9 241 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 TGM7Q96PF1 710 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 NDRG3Q9UGV2 375 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 FBXO4Q9UKT5 387 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 SLC5A10A0PJK1 596 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 PRSS38A1L453 326 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 EPOPA6NHQ4 379 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 WRBO00258 174 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 PLPP1O14494 284 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 AKR7A3O95154 331 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 CISD3P0C7P0 127 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 RAB6AP20340 208 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 MAKP20794 623 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 CCKBRP32239 447 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 MAP3K8P41279 467 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTC1-201ENST00000290378 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms