RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 MIXL1Q9H2W2 232 aa9.9□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 TINAGQ9UJW2 476 aa9.9□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 OTOFQ9HC10 1997 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 A0A1W2PPE2 198 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 LRP5LA4QPB2 252 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 M0QYG6 137 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 SLC25A12O75746 678 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 MPC2O95563 127 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 PIPP12273 146 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 SLC27A1Q6PCB7 646 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 CYB561A3Q8NBI2 242 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 OR6K2Q8NGY2 324 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 IL22RA2Q969J5 263 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 FAM46BQ96A09 425 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 FAM122AQ96E09 287 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 SRMSQ9H3Y6 488 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 SERINC1Q9NRX5 453 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 CENPMQ9NSP4 180 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF541Q9H0D2 1346 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 A0A1B0GV72 72 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 F6UZH7 168 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 NDUFA2O43678 99 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 C8GP07360 202 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 PSMB10P40306 273 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 RABGGTBP53611 331 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 BPIFB3P59826 476 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 HERV-K104P61576 105 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 ILKQ13418 452 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 DHCR24Q15392 516 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 EIPR1Q53HC9 387 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF534Q76KX8 674 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 CLDN19Q8N6F1 224 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 EXD3Q8N9H8 876 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 FAM71CQ8NEG0 241 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 OR5L1Q8NGL2 311 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 OR6N2Q8NGY6 317 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 SAMD8Q96LT4 415 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 K7ERQ8 282 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 LRP3O75074 770 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 OR2J2O76002 312 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 FGF2P09038 288 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF823P16415 610 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 MMP11P24347 488 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 SERPINA4P29622 427 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 RAB28P51157 221 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 LINC00303Q3SY05 128 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 PYCR3Q53H96 274 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 GDPD4Q6W3E5 623 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF738Q8NE65 137 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 GHSRQ92847 366 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 EGLN2Q96KS0 407 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 LYSMD1Q96S90 227 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 OR51B6Q9H340 312 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 RLIMQ9NVW2 624 aa9.89□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 RECQL4O94761 1208 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 RECKO95980 971 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 RENP00797 406 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 GP1BAP07359 652 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 HBQ1P09105 142 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 EPXP11678 715 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 FDXRP22570 491 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 SULT1A1P50225 295 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM35AQ53FP2 167 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 OR52N2Q8NGI0 321 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 PTPN18Q99952 460 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 OR5V1Q9UGF6 321 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 COL1A2P08123 1366 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 ANHXE9PGG2 379 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 GREM1O60565 184 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 MTX2O75431 263 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 ELFN1P0C7U0 828 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 METTL15P1P0C7V9 234 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 CCKBRP32239 447 aa9.88□□□□□ -0.83
KPNA3-201ENST00000261667 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms