RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 SLC6A17Q9H1V8 727 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 DOCK2Q92608 1830 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 A0A0U1RQS6 177 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SLC35D2Q76EJ3 337 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SERPINA11Q86U17 422 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 OR11A1Q9GZK7 315 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 MYBPHQ13203 477 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SLC35G3Q8N808 338 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 MROH6A6NGR9 719 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 METTL15A6NJ78 407 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 PMP2P02689 132 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 KCNJ15Q99712 375 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ARV1Q9H2C2 271 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SEMA6CQ9H3T2 930 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 STYXL1Q9Y6J8 313 aa15.3■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 FCER1GP30273 86 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SLC6A19Q695T7 634 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 PODNL1Q6PEZ8 512 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 G3V3Y1 287 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 HBE1P02100 147 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 RPA2P15927 270 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SLC1A3P43003 542 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SLC35A1P78382 337 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF595Q8IYB9 648 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 NMES1Q9C002 83 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 GALNT9Q9HCQ5 603 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM181Q9P2C4 612 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 C5P01031 1676 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 DEGS1O15121 323 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 TAF9Q16594 264 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ISYNA1Q9NPH2 558 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 OSGIN2Q9Y236 505 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 RAB40BQ12829 278 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CATSPERDQ86XM0 798 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 AQP9O43315 295 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 RAB40ALP0C0E4 278 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 PRKACAP17612 351 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 PRKACBP22694 351 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 UBAC2Q8NBM4 344 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SLC30A7Q8NEW0 376 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 OR5D18Q8NGL1 313 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 RAB40AQ8WXH6 277 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 TIMD4Q96H15 378 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 KATNB1Q9BVA0 655 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 C4orf47A7E2U8 309 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SPINT2O43291 252 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 YIF1AO95070 293 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF597Q96LX8 424 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ACPTQ9BZG2 426 aa15.29■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CLLU1OSQ5K130 101 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 OR8G2PQ6IF36 304 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ADGRG5Q8IZF4 528 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CD200R1Q8TD46 325 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 LINC01599Q8WXQ3 324 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 BTAF1O14981 1849 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 A0A0B4J2A0 478 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 NME4O00746 187 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 HSD17B1P14061 328 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 BIDP55957 195 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SLC6A18Q96N87 628 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 OBP2AQ9NY56 170 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SHPKQ9UHJ6 478 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CPMP14384 443 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SVBPQ8N300 66 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 OR52D1Q9H346 318 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 PGAP2Q9UHJ9 254 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CSN1S1P47710 185 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 DCAF7P61962 342 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 KDM8Q8N371 416 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 C15orf54Q8N8G6 183 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 FNDC8Q8TC99 324 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 HLA-HP01893 362 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 OR13C2Q8NGS9 318 aa15.28■□□□□ 0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms