RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 SPCS2Q15005 226 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXC6-201ENST00000243108 CD226Q15762 336 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM44Q2T9K0 475 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXC6-201ENST00000243108 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXC6-201ENST00000243108 DESI1Q6ICB0 168 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXC6-201ENST00000243108 PRR22Q8IZ63 422 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXC6-201ENST00000243108 HSPBAP1Q96EW2 488 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
HOXC6-201ENST00000243108 TAS2R16Q9NYV7 291 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXC6-201ENST00000243108 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXC6-201ENST00000243108 SIGLEC7Q9Y286 467 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXC6-201ENST00000243108 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 CLDN14O95500 239 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 NGFRP08138 427 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 UBL4AP11441 157 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 GRK5P34947 590 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 PSPHP78330 225 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 GXYLT1Q4G148 440 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 AADACL4Q5VUY2 407 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 APOOLQ6UXV4 268 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 CADM2Q8N3J6 435 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ANKK1Q8NFD2 765 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OR5M9Q8NGP3 310 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ICAM5Q9UMF0 924 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 A0A087WUJ7 227 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SNTNA6NMZ2 147 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 EFCAB9A8MZ26 197 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 BHLHE40O14503 412 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 PTP4A3O75365 173 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 BCL10O95999 233 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 HPGDP15428 266 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 FUT1P19526 365 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 NR4A1P22736 598 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SLC43A2Q8N370 569 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 LNX2Q8N448 690 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OR13C2Q8NGS9 318 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 NTNG2Q96CW9 530 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ADOQ96SZ5 270 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ZFP64Q9NPA5 681 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SPRR3Q9UBC9 169 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 GPR52Q9Y2T5 361 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OTOGQ6ZRI0 2925 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 MED12Q93074 2177 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 A0A1W2PQD3 144 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 IRGMA1A4Y4 181 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF264O43296 627 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OIP5O43482 229 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 HCN1O60741 890 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ICOSLGO75144 302 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 REM1O75628 298 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 CH25HO95992 272 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ABCD3P28288 659 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 IL12BP29460 328 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 COPZ1P61923 177 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 RAB40BQ12829 278 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SLC10A1Q14973 349 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 KLHL22Q53GT1 634 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 RTL6Q6ICC9 239 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SMARCD3Q6STE5 483 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 MCEMP1Q8IX19 187 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 C3orf49Q96BT1 292 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 PLEKHA8Q96JA3 519 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OR5M11Q96RB7 305 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 RACGAP1Q9H0H5 632 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 FAM215AQ9Y5M1 114 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 HEATR5AQ86XA9 2040 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 AQP7O14520 342 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 RAB36O95755 333 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SAGP10523 405 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 BMP7P18075 431 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 PNLIPRP2P54317 469 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 PLCXD2Q0VAA5 305 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 FHL1Q13642 323 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ARMCX4Q5H9R4 360 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 WBP2NLQ6ICG8 309 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 THSD4Q6ZMP0 1018 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 GATSQ8NAP1 163 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 RFKQ969G6 155 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 LGALS12Q96DT0 336 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OMA1Q96E52 524 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SLC19A3Q9BZV2 496 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 LAT2Q9GZY6 243 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ENKD1Q9H0I2 346 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SLC6A15Q9H2J7 730 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXC6-201ENST00000243108 FN3KQ9H479 309 aa15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms