RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccr4P51680 360 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 EgflamQ4VBE4 1017 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Clec4a4Q5YIR8 236 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr12Q60894 333 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Alg8Q6P8H8 526 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc30a8Q8BGG0 367 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cadm2Q8BLQ9 435 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn1r32Q8R2D9 302 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cbx7Q8VDS3 158 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr763Q8VGC1 309 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr582Q8VGV9 319 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CrebzfQ91ZR3 358 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adarb1Q91ZS8 711 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bcl7bQ921K9 202 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc19a3Q99PL8 488 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dapl1Q9D757 107 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Erv3Q9DAX3 200 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tor3aQ9ER38 385 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adamdec1Q9R0X2 467 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Szt2A2A9C3 3431 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ckap5A2AGT5 2032 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm21865A0A087WRL2 222 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1338A2ACY7 313 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm13102A2ASJ3 519 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1314A2AVL6 312 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm20518E9Q548 580 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 H2-M11F6U8V3 335 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P03987 398 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hsd3b3P26150 373 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Klrb1cP27814 223 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nkx2-6P43688 289 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ParpbpQ6IRT3 573 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chst14Q80V53 376 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmbim1Q8BJZ3 309 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem222Q8BVA2 208 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q8C784 167 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rhno1Q8K3A4 235 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ndc1Q8VCB1 673 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr676Q8VGZ9 317 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mfsd2aQ9DA75 534 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mllt1Q9ERL0 547 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Scamp2Q9ERN0 329 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lgals8Q9JL15 316 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 9930021J03RikH3BKP8 2027 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Col4a4Q9QZR9 1682 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1432A0A140LHS7 346 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 A0A286YCH8 300 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 3110040M04RikA0A286YDK0 300 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 A0A286YE43 300 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm6401L7N2C0 213 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp4a10O88833 509 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TtkP35761 856 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rps4xP62702 263 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ElocP83940 112 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tssk1bQ61241 365 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cd47Q61735 303 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Foxb2Q64733 428 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 2610318N02RikQ80VT5 305 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NdnfQ8C119 568 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wdr37Q8CBE3 496 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Colec10Q8CF98 277 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PhyhipQ8K0S0 330 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lsm10Q8QZX5 122 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr870Q8VGG4 311 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kiaa2013Q91X21 634 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Taar1Q923Y8 332 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ptp4a3Q9D658 173 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 B4galt2Q9Z2Y2 369 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4932443I19RikA0A286YE38 169 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Col9a3A2ACT7 680 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GlsD3Z7P3 674 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prps1l3G3UXL2 318 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm11168J3QN50 228 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm21915J3QPM7 133 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rasd1O35626 280 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ly6aP05533 134 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PnmtP40935 295 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ctbp2P56546 445 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdk5r1P61809 307 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Serpine2Q07235 397 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rab42Q0PD08 215 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Foxd3Q61060 465 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrrn1Q61809 716 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tha1Q6XPS7 400 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chst9Q76EC5 413 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Doc2aQ7TNF0 405 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1161Q7TR29 321 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1065Q7TR70 313 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hapln3Q80WM5 359 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zc3h12dQ8BIY3 533 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hbq1aQ8BYM1 145 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zbtb26Q8C8S0 451 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gpr1Q8K087 353 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sf3b4Q8QZY9 424 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem185bQ8R3R5 350 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn1r42Q8VBS7 329 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Egln3Q91UZ4 239 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Taldo1Q93092 337 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cstf1Q99LC2 431 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrm2Q9CPY0 246 aa16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.3 ms