RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641658.1

MFSD8-240, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 1,731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-240	ENST00000641658	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658		B9A039	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658		C9JVG2	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	RIPK2	O43353	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	NKX2-2	O95096	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SYNGR4	O95473	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	FSHB	P01225	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SHBG	P04278	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63	3e-6	■□□□□ 11.2
MFSD8-240	ENST00000641658	GSTA1	P08263	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	LINC00032	P0C843	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SDC1	P18827	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	EDNRA	P25101	427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ACVR1B	P36896	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	MAP3K8	P41279	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	PCYT1A	P49585	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CARD18	P57730	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	VEZF1	Q14119	521 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CBLN3	Q6UW01	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	HTRA1	Q92743	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CDS1	Q92903	461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	EBAG9	O00559	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	RAMP1	O60894	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	NUDT14	O95848	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ADA	P00813	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ABHD2	P08910	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ALOX5	P09917	674 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF17	P17021	662 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	PSPH	P78330	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF117	Q03924	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	TAB1	Q15750	504 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CPTP	Q5TA50	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658		Q6ZSR9	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	COX18	Q8N8Q8	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM110B	Q8TC76	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	AGR3	Q8TD06	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	PPCDC	Q96CD2	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	REEP4	Q9H6H4	257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-240	ENST00000641658	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.1 ms