RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-222	ENST00000639501	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	KCT2	Q8NC54	265 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	MIB2	Q96AX9	1013 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	CTNS	O60931	367 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF254	O75437	659 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	NID1	P14543	1247 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	FGL1	Q08830	312 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	C11orf88	Q6PI97	169 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	NRROS	Q86YC3	692 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	RASL12	Q9NYN1	266 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PMS1-222	ENST00000639501	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	DNAJB6	O75190	326 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	SNAPC5	O75971	98 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	ACR	P10323	421 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	ID2	Q02363	134 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	LGALS3BP	Q08380	585 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	KRT33B	Q14525	404 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	NXPE3	Q969Y0	559 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501		A0A1B0GVT2	93 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	SOX2	P48431	317 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	GXYLT1	Q4G148	440 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	C12orf57	Q99622	126 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501		H3BSH0	61 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	GPR31	O00270	319 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	GNB5	O14775	395 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	IFNG	P01579	166 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	MAOB	P27338	520 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	GGTLC2	Q14390	218 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	DCST2	Q5T1A1	773 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	ZAR1	Q86SH2	424 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	SLC6A6	P31641	620 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	RAB28	P51157	221 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	CDK3	Q00526	305 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	HFE	Q30201	348 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF75A	Q96N20	296 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	OR2W5	A6NFC9	320 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	C4orf47	A7E2U8	309 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501		H0YC42	278 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	GPRIN2	O60269	458 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	PRNP	P04156	253 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	CD1A	P06126	327 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	SERTAD2	Q14140	314 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PMS1-222	ENST00000639501	NMNAT3	Q96T66	252 aa		18.74	■□□□□ 0.59

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