RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 FXNQ16595 210 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 SDR9C7Q8NEX9 313 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 OR9I1Q8NGQ6 314 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 SCLYQ96I15 445 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 PADI1Q9ULC6 663 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 OR6C68A6NDL8 312 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 I6L893 689 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 KCNJ3P48549 501 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM107Q6UX40 140 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 Q6ZVU0 165 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 DOK3Q7L591 496 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 REC114Q7Z4M0 266 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 CLEC1AQ8NC01 280 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 RAB8BQ92930 207 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 SLC23A2Q9UGH3 650 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 EBF1Q9UH73 591 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 KCTD3Q9Y597 815 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF732B4DXR9 585 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 ACSM4P0C7M7 580 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 HLA-FP30511 346 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 BAXQ07812 192 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 DMWDQ09019 674 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 DEFB134Q4QY38 66 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 APOOLQ6UXV4 268 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 NPSR1Q6W5P4 371 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 SLC16A14Q7RTX9 510 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 SLC24A4Q8NFF2 622 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 OR5M3Q8NGP4 307 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 OR13C9Q8NGT0 318 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 SLCO4A1Q96BD0 722 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 OR52D1Q9H346 318 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 CLMPQ9H6B4 373 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 CBLCQ9ULV8 474 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 SUSD5O60279 629 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 PAPLNO95428 1278 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 CDH26Q8IXH8 852 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 SYS1Q8N2H4 156 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 STACQ99469 402 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 BEX2Q9BXY8 128 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 CHST6Q9GZX3 395 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 BEX1Q9HBH7 125 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 DMRT3Q9NQL9 472 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 FBXO8Q9NRD0 319 aa5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 ARAFP10398 606 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 TIMP2P16035 220 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 FIGLAQ6QHK4 219 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 TFAP2EQ6VUC0 442 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 LIPIQ6XZB0 460 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 IL22RA1Q8N6P7 574 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 DMBX1Q8NFW5 382 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 OR13F1Q8NGS4 319 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 MRGPRX2Q96LB1 330 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 GNG12Q9UBI6 72 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1B0GUH1 482 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 C9JVG2 144 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF44P15621 663 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 MGMTP16455 207 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 IL1R2P27930 398 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 KIR2DS2P43631 304 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 CCL23P55773 120 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 GTDC1Q4AE62 458 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 Q8IYB0 196 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 GJC3Q8NFK1 279 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 SMOQ99835 787 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 GINS3Q9BRX5 216 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 BCO1Q9HAY6 547 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 A4GALTQ9NPC4 353 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 PRKAB1Q9Y478 270 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 MYO5BQ9ULV0 1848 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 IGLON5A6NGN9 336 aa5.92□□□□□ -1.46
SCN2A-209ENST00000636071 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms