RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	GABRA4	P48169	554 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	XK	P51811	444 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PYDC2	Q56P42	97 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	NUDT13	Q86X67	352 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2T11	Q8NH01	316 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	COL21A1	Q96P44	957 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PELI2	Q9HAT8	420 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	NLK	Q9UBE8	527 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MED12	Q93074	2177 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRK2	Q5S007	2527 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	FGF17	O60258	216 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PLOD3	O60568	738 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	HRG	P04196	525 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	FOLR2	P14207	255 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	IGFBP5	P24593	272 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	LIM2	P55344	173 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAJB13	P59910	316 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SQSTM1	Q13501	440 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OPCML	Q14982	345 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	LIPJ	Q5W064	366 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	REC114	Q7Z4M0	266 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ARSG	Q96EG1	525 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	C14orf144	Q96I85	54 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF382	Q96SR6	550 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SPSB2	Q99619	263 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DUSP26	Q9BV47	211 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR14	Q9BWN1	585 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CENPE	Q02224	2701 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PR48	441 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	C5orf52	A6NGY3	159 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ACOD1	A6NK06	481 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CLEC3A	O75596	197 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	AIFM1	O95831	613 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SSTR2	P30874	369 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DCT	P40126	519 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PTGFR	P43088	359 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGEA2	P43356	314 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	EFNA3	P52797	238 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TMPRSS3	P57727	454 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SKP1	P63208	163 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CAMK2D	Q13557	499 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PWP1	Q13610	501 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	NFYC	Q13952	458 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SNAPC1	Q16533	368 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	HSDL2	Q6YN16	418 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	COX15	Q7KZN9	410 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	IFNE	Q86WN2	208 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM17	Q86X19	198 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DTX1	Q86Y01	620 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MIER2	Q8N344	545 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF614	Q8N883	585 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2M2	Q96R28	347 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	LPAR4	Q99677	370 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	METTL9	Q9H1A3	318 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35

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