RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HLA-DMAP28067 261 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TACR3P29371 465 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC6A1P30531 599 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EVI2BP34910 448 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACTA2P62736 377 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACTG2P63267 376 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GGTLC2Q14390 218 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GRM7Q14831 915 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDK10Q15131 360 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALG10Q5BKT4 473 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HES5Q5TA89 166 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1orf189Q5VU69 101 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYS1Q8N2H4 156 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOXN4Q96NZ1 517 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MMP25Q9NPA2 562 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MED12Q93074 2177 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LILRA5A6NI73 299 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RHPN2P1A8MT19 583 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOTOA8MTQ0 251 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HCRTR2O43614 444 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR8G3PP0DMU2 310 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BTCP35070 178 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRPS1P60891 318 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFHR1Q03591 330 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ODF4Q2M2E3 257 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC36A2Q495M3 483 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCL2L15Q5TBC7 163 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM71CQ8NEG0 241 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF671Q8TAW3 534 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MESP1Q9BRJ9 268 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUDT15Q9NV35 164 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF215Q9Y6U7 377 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RGS13O14921 159 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ORC5O43913 435 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UCHL1P09936 223 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SRMP19623 302 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITPKBP27987 946 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SERTAD2Q14140 314 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EFR3AQ14156 821 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NTRK2Q16620 822 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSD17B12Q53GQ0 312 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCTE1Q5JU00 501 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STPG1Q5TH74 334 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM122BQ7Z309 247 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MARCH3Q86UD3 253 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 JAZF1Q86VZ6 243 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SERPINA12Q8IW75 414 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LGALS14Q8TCE9 139 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAAR8Q969N4 342 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GFI1Q99684 422 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUDT9Q9BW91 350 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EVA1AQ9H8M9 152 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD10Q9NXR5 420 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa10.74□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM172BPA6NC97 362 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H0YIG0 161 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF217O75362 1048 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GLCEO94923 617 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL33O95760 270 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUDT14O95848 222 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DDAH2O95865 285 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD14P08571 375 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPICP45877 212 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLA1AQ53H76 456 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEX19Q8NA77 164 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF527Q8NB42 609 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FKRPQ9H9S5 495 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RXFP3Q9NSD7 469 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CACNG2Q9Y698 323 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A0A6YYJ9 748 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C11orf98E9PRG8 122 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC43A1O75387 559 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARL6IP5O75915 188 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SERPINA3P01011 423 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 YES1P07947 543 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SRFP11831 508 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOLR1P15328 257 aa10.73□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RORAP35398 523 aa10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 215.7 ms