RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF684Q5T5D7 378 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OVCH1Q7RTY7 1134 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC35F3Q8IY50 421 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRR22Q8IZ63 422 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TP53INP1Q96A56 240 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LPAR4Q99677 370 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1B0GX78 115 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ALG1L2C9J202 215 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GIMD1P0DJR0 217 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PSKH1P11801 424 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLDN20P56880 219 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NSDHLQ15738 373 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PYHIN1Q6K0P9 492 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC16A9Q7RTY1 509 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC25A45Q8N413 288 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR1N1Q8NGS0 311 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM63Q969Q1 353 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KLHDC3Q9BQ90 382 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WACQ9BTA9 647 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NDEL1Q9GZM8 345 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FKRPQ9H9S5 495 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RXFP3Q9NSD7 469 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EXPH5Q8NEV8 1989 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FLRT2O43155 660 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FZD7O75084 574 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PAHP00439 452 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EPXP11678 715 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATF1P18846 271 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SNAP47Q5SQN1 464 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HACD4Q5VWC8 232 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC6A19Q695T7 634 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LYPD4Q6UWN0 246 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RFT1Q96AA3 541 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR14A2Q96R54 314 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SNX18Q96RF0 628 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MARVELD1Q9BSK0 173 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR2B2Q9GZK3 357 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NRSN2Q9GZP1 204 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COPS7AQ9UBW8 275 aa15□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR6C76A6NM76 312 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HCRTR2O43614 444 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PNLIPRP2P54317 469 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BCL2A1Q16548 175 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TAAR8Q969N4 342 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NLKQ9UBE8 527 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDC14CA4D256 554 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C4orf47A7E2U8 309 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRR32B1ATL7 298 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NDUFB5O43674 189 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC43A1O75387 559 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SERPINI2O75830 405 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 F13BP05160 661 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TFPIP10646 304 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PSMB10P40306 273 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLCXD2Q0VAA5 305 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TATDN3Q17R31 274 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZFP69Q49AA0 526 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MESTQ5EB52 335 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPR139Q6DWJ6 353 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF511Q8NB15 262 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLPP5Q8NEB5 264 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR5H6Q8NGV6 325 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UPRTQ96BW1 309 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OMA1Q96E52 524 aa14.99□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CMTM3Q96MX0 182 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms