RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPIBQ01892 262 aa29.41■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 RRM2BQ7LG56 351 aa29.41■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa29.41■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR9K2Q8NGE7 335 aa29.41■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5J2Q8NH18 312 aa29.41■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 CANT1Q8WVQ1 401 aa29.41■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 AURKCQ9UQB9 309 aa29.41■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 GADD45GO95257 159 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASAH2BP0C7U1 165 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 PMS2P3Q13401 168 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRMQ8IXM6 262 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 BPIFA2Q96DR5 249 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 FREM1Q5H8C1 2179 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIP5K1CO60331 668 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 RRM2P31350 389 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf146Q5VVC0 180 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 PODNL1Q6PEZ8 512 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 STK32CQ86UX6 486 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC17Q8N6Y2 441 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 LIPHQ8WWY8 451 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 OXGR1Q96P68 337 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST1H2ABP04908 130 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFI30P13284 250 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 FUT1P19526 365 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 PUDPQ08623 228 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBPL2Q6SJ96 375 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 KDM8Q8N371 416 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF610Q8N9Z0 462 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52J3Q8NH60 311 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST1H2ACQ93077 130 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 B3GAT1Q9P2W7 334 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa29.39■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLPP3O14495 311 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR7A10O76100 309 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF43P17038 809 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKCDQ05655 676 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 TFAP2EQ6VUC0 442 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 CREB3L2Q70SY1 520 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 MS4A18H0YCH9 400 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 CIB2O75838 187 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT36O76013 467 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR3A2P47893 321 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 MS4A18Q3C1V0 323 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM45BQ96B21 275 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 FUZQ9BT04 418 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHID1Q9BWS9 393 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 FANCFQ9NPI8 374 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 PARPBPQ9NWS1 579 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADORA3P0DMS8 318 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRNP28799 593 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL1RL1Q01638 556 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDK20Q8IZL9 346 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZIC4Q8N9L1 334 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 C19orf84I3L1E1 186 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6A2O95222 327 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 NTF4P34130 210 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERFP50548 548 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 BEND4Q6ZU67 534 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPHX4Q8IUS5 362 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF100Q8IYN0 542 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 GALNT8Q9NY28 637 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM5Q9Y2B1 443 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 AHCYP23526 432 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 UQCRC1P31930 480 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 HMGA2P52926 109 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1DQ13901 141 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEC23BQ15437 767 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2T5Q6IEZ7 315 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 PXKQ7Z7A4 578 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 UEVLDQ8IX04 471 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4K5Q8NGD3 323 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2T29Q8NH02 315 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 APH1AQ96BI3 265 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALPK1Q96QP1 1244 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELOVL5Q9NYP7 299 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R5Q9NYW4 299 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOX1Q9Y5S8 564 aa29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms