RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564841.1

LINC00554-201, long intergenic non-protein coding RNA 554, humanhuman

BASIC

Gene LINC00554, Length 3,011 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00554-201ENST00000564841 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 VITQ6UXI7 678 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 SVBPQ8N300 66 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 SLC41A3Q96GZ6 507 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 TRAV27A0A087WT01 109 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 STX11O75558 287 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 PCCBP05166 539 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 FOSL1P15407 271 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 GMFBP60983 142 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 C5orf46Q6UWT4 87 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 TRAM1L1Q8N609 369 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 FGF14Q92915 247 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 FAM117AQ9C073 453 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 FBXO4Q9UKT5 387 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 ZNF337Q9Y3M9 751 aa14.94□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 A0A1W2PPE3 182 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 SYT5O00445 386 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 ADRB3P13945 408 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 DPP4P27487 766 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 GJA4P35212 333 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 KCNAB1Q14722 419 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 PARM1Q6UWI2 310 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 OR6S1Q8NH40 331 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 PELI1Q96FA3 418 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 AMDHD1Q96NU7 426 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 MKL2Q9ULH7 1088 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 IMPA2O14732 288 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 TXNL1O43396 289 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 KLF4O43474 513 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 IL5P05113 134 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 PRLHRP49683 370 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 PPP2CBP62714 309 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 PPP2CAP67775 309 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 IL10RAQ13651 578 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 TGIF1Q15583 401 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 AVPI1Q5T686 147 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 RAB12Q6IQ22 244 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 DPPA4Q7L190 304 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 NUS1Q96E22 293 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 SLC38A1Q9H2H9 487 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 FN3KQ9H479 309 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 OR5V1Q9UGF6 321 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 SCN2AQ99250 2005 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.93□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 GKN3PP0CG01 181 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 SRMP19623 302 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 GRPRP30550 384 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 AP3S2P59780 193 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 OR7A5Q15622 319 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 MICBQ29980 383 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 GAB4Q2WGN9 574 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 C3orf49Q96BT1 292 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 GAL3ST1Q99999 423 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 KCNK15Q9H427 330 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 FAM96BQ9Y3D0 163 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 IFITM5A6NNB3 132 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 MAN2B1O00754 1011 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 SPINT1O43278 529 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 KAT7O95251 611 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 RPA2P15927 270 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 RUNX3Q13761 415 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 GID4Q8IVV7 300 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 MYADMQ96S97 322 aa14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LINC00554-201ENST00000564841 GHRLQ9UBU3 117 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms