RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP4B	P51164	291 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CTBP2	P56545	445 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CLDN20	P56880	219 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CARD18	P57730	90 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	COPZ1	P61923	177 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	SIRPA	P78324	504 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNJ10	P78508	379 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF117	Q03924	483 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	MERTK	Q12866	999 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	ART3	Q13508	389 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CBFB	Q13951	182 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	QPRT	Q15274	297 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	RGN	Q15493	299 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CD226	Q15762	336 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	HSPB2	Q16082	182 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	MAPK14	Q16539	360 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP51A1	Q16850	503 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	RTL6	Q6ICC9	239 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CBLN3	Q6UW01	205 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	MISP	Q8IVT2	679 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR119	Q8TDV5	335 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM234	Q8WY98	164 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	GTF2H4	Q92759	462 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	OSTF1	Q92882	214 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	MAL2	Q969L2	176 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	LAT2	Q9GZY6	243 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	GID8	Q9NWU2	228 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CALML5	Q9NZT1	146 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	ARMCX1	Q9P291	453 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A087WZY1	265 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1W2PQD3	144 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC22A20	A6NK97	555 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	GJE1	A6NN92	205 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288		H0YIZ8	118 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	PSMD9	O00233	223 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAM10	O14672	748 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	MRAS	O14807	208 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CXCL13	O43927	109 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CHRM4	P08173	479 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	TFPT	P0C1Z6	253 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	COX4I1	P13073	169 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	UQCRB	P14927	111 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CPN1	P15169	458 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	IL11	P20809	199 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CXCR1	P25024	350 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	PCSK6	P29122	969 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CHRNB4	P30926	498 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	PTGER4	P35408	488 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CPA2	P48052	419 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	LHX2	P50458	406 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-238	ENST00000556288	CRISP3	P54108	245 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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