RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 FABP6P51161 128 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 SLC25A3Q00325 362 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 TNK1Q13470 666 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 OR1Q1Q15612 314 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 HMBOX1Q6NT76 420 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 DTX2Q86UW9 622 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 DPP10Q8N608 796 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF417Q8TAU3 575 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 TAAR8Q969N4 342 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 OXGR1Q96P68 337 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 EPYCQ99645 322 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 SEC14L4Q9UDX3 406 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 MFN2O95140 757 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 CD8AP01732 235 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 NQO1P15559 274 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 GRPRP30550 384 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 TTKP33981 857 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 DMTNQ08495 405 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 RBBP4Q09028 425 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 RETREG3Q86VR2 466 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 C10orf53Q8N6V4 93 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 TSPEARQ8WU66 669 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 EVA1AQ9H8M9 152 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 SLC43A1O75387 559 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 UPK3AO75631 287 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 OPN1SWP03999 348 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 ACVR1BP36896 505 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 SELPLGQ14242 412 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 TBRG1Q3YBR2 411 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 METTL21CQ5VZV1 264 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 PTOV1Q86YD1 416 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 MUC15Q8N387 334 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 OR1K1Q8NGR3 316 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 KCNS3Q9BQ31 491 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 ASPNQ9BXN1 380 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 CACNG6Q9BXT2 260 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 GRIP2Q9C0E4 1043 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 OBP2BQ9NPH6 170 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 CBLN4Q9NTU7 201 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 KLHL14Q9P2G3 628 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 RCE1Q9Y256 329 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 NF1P21359 2839 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCH-216ENST00000555542 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 A0A087WUJ7 227 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 A0A0B4J2E0 115 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 A0A1B0GX12 115 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 M0R3H8 397 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 IGHV4-39P01824 125 aa21.39■■□□□ 1.01
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PRKCH-216ENST00000555542 NRF1Q16656 503 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 B3GLCTQ6Y288 498 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 SLC30A8Q8IWU4 369 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 GPR137CQ8N3F9 429 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 SLC26A7Q8TE54 656 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 MCHR1Q99705 422 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 LINC00470Q9BZP3 86 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 RNF223E7ERA6 249 aa21.38■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 M0QX08 132 aa21.38■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 NDUFS7O75251 213 aa21.38■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 CDH12P55289 794 aa21.38■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 UEVLDQ8IX04 471 aa21.38■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 B3GAT1Q9P2W7 334 aa21.38■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 A0A096LPE4 126 aa21.37■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 A0A1W2PPZ6 126 aa21.37■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa21.37■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 SSX4O60224 188 aa21.37■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 PCSK6P29122 969 aa21.37■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 NUDT6P53370 316 aa21.37■■□□□ 1.01
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PRKCH-216ENST00000555542 PPP2R2BQ00005 443 aa21.37■■□□□ 1.01
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PRKCH-216ENST00000555542 MMEL1Q495T6 779 aa21.37■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF544Q6NX49 715 aa21.37■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 LINGO2Q7L985 606 aa21.37■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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PRKCH-216ENST00000555542 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 WFDC6Q9BQY6 131 aa21.37■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 MOKQ9UQ07 419 aa21.37■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 CORINQ9Y5Q5 1042 aa21.37■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 BMP4P12644 408 aa21.36■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 PMS2P3Q13401 168 aa21.36■■□□□ 1.01
PRKCH-216ENST00000555542 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
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