RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553287.5

ATXN3-217, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 726 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-217ENST00000553287 C8orf44Q96CB5 159 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 C14orf79Q96F83 325 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 SERINC2Q96SA4 455 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 C11orf70Q9BRQ4 267 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 HES7Q9BYE0 225 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 NT5DC2Q9H857 520 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 NT5MQ9NPB1 228 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 ETNK2Q9NVF9 386 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 HRASLS2Q9NWW9 162 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 DNAJC12Q9UKB3 198 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 ETV7Q9Y603 341 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa3.4□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 SLC19A2O60779 497 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 FHP07954 510 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 OR9G9P0C7N8 305 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 CYP11B1P15538 503 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 CMA1P23946 247 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 SDC4P31431 198 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 CSNK1DP48730 415 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 STC1P52823 247 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 TPI1P60174 286 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 ARG2P78540 354 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 OGDHQ02218 1023 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 NFE2L1Q14494 772 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 ABRAXAS2Q15018 415 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 PARP15Q460N3 678 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 XKRXQ6PP77 449 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF730Q6ZMV8 503 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 RPRMLQ8N4K4 120 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 DNAAF3Q8N9W5 541 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 TMEM35BQ8NCS4 154 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 GPR26Q8NDV2 337 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 LPCAT1Q8NF37 534 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 BEST4Q8NFU0 473 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 OR4E2Q8NGC2 313 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 NELFBQ8WX92 580 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 PEBP4Q96S96 227 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 SPATA16Q9BXB7 569 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 CXXC4Q9H2H0 198 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 XKR8Q9H6D3 395 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF160Q9HCG1 818 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 FAM60AQ9NP50 221 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 GPR173Q9NS66 373 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 PCSK1NQ9UHG2 260 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 PCM1Q15154 2024 aa3.39□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 TRAV34A0A0B4J273 112 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 A0A0J9YYE9 177 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 GSAPA4D1B5 854 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 TLCD2A6NGC4 264 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 ARHGAP42A6NI28 874 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 OR2AG2A6NM03 316 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 OR5K4A6NMS3 321 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 C9J4A7 227 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 BTN3A3O00478 584 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 OR6A2O95222 327 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 TRBC1P01850 177 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF19P17023 458 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 IER3P46695 156 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 SPINT3P49223 89 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 KLK7P49862 253 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 TNFSF10P50591 281 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 AP1S1P61966 158 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 LRRC63Q05C16 580 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 ZIC1Q15915 447 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 IQCCQ4KMZ1 466 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 IGFL2Q6UWQ7 119 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 KLHL7Q8IXQ5 586 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 FAM71AQ8IYT1 594 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 UXS1Q8NBZ7 420 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 OR2Y1Q8NGV0 311 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 MCEEQ96PE7 176 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 PSKH2Q96QS6 385 aa3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
ATXN3-217ENST00000553287 FOXC2Q99958 501 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms