RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552197.5

SLC38A1-210, Transcript of solute carrier family 38 member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC38A1, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A1-210ENST00000552197 CLN3Q13286 438 aa9.96□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.96□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 NIPAL3Q6P499 406 aa9.96□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 PAQR6Q6TCH4 344 aa9.96□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 SLC43A2Q8N370 569 aa9.96□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 ZPLD1Q8TCW7 415 aa9.96□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 SMPDL3BQ92485 455 aa9.96□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 TMEM41AQ96HV5 264 aa9.96□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 OR5B2Q96R09 309 aa9.96□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.96□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 GRHPRQ9UBQ7 328 aa9.96□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 FTCDNL1E5RQL4 147 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 ZIC3O60481 467 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 HSMCR30P0CW71 290 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 NR4A1P22736 598 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 SHC1P29353 583 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 HTR1FP30939 366 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 IDUAP35475 653 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 RFC3P40938 356 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 EIF1P41567 113 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 CCL11P51671 97 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 DLX5P56178 289 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 MYBPHQ13203 477 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 MED22Q15528 200 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 OR1C1Q15619 314 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 SGCBQ16585 318 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 KLHL22Q53GT1 634 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 OR51G2Q8NGK0 314 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 THAP4Q8WY91 577 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 ZBTB8AQ96BR9 441 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 ASPNQ9BXN1 380 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 VGLL3A8MV65 326 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 H7C1C5 153 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 ARPC3O15145 178 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 TRAPPC6AO75865 159 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 AKR7A3O95154 331 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 RAB36O95755 333 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 RRADP55042 308 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 LCN6P62502 163 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 LEG1Q6P5S2 330 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 C5orf46Q6UWT4 87 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 GID4Q8IVV7 300 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 NTNG2Q96CW9 530 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 AGAP4Q96P64 663 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 TSPAN32Q96QS1 320 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 OR5M11Q96RB7 305 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 KLHL21Q9UJP4 597 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.95□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 A0A087WZY1 265 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 OR2M5A3KFT3 312 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 OR6C68A6NDL8 312 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 PLPP3O14495 311 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 HLA-DOBP13765 273 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 CNR1P21554 472 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 SDHAP31040 664 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 ETV1P50549 477 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 RAB40BQ12829 278 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 IRF3Q14653 427 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 TBC1D25Q3MII6 688 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 ANKDD1AQ495B1 522 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 FAM122BQ7Z309 247 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 NPEPL1Q8NDH3 523 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 MFSD8Q8NHS3 518 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 NXPE2Q96DL1 559 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 TEAD3Q99594 435 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 YIPF3Q9GZM5 350 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 ERGIC3Q9Y282 383 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 LRRC3CA6NJW4 275 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 LIPT2A6NK58 231 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 FAM171A2A8MVW0 826 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 TSPAN19P0C672 248 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 ADH6P28332 368 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 TTKP33981 857 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 TLE3Q04726 772 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 SELENBP1Q13228 472 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 DOC2BQ14184 412 aa9.94□□□□□ -0.82
SLC38A1-210ENST00000552197 TIGD6Q17RP2 521 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms