RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 AP1ARQ63HQ0 302 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 WBP2NLQ6ICG8 309 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 NIPAL3Q6P499 406 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ANKRD16Q6P6B7 361 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ANKFN1Q8N957 763 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 CCDC115Q96NT0 180 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 SOX7Q9BT81 388 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 CA10Q9NS85 328 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 CALML5Q9NZT1 146 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 RASD1Q9Y272 281 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 RAP2CQ9Y3L5 183 aa7.36□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 A0A096LPE4 126 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 A0A096LPI6 279 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 A0A1W2PPZ6 126 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 POM121CA8CG34 1229 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 E9PBE3 544 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 AHSA1O95433 338 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ANP32DO95626 131 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 DAOP14920 347 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 NPR2P20594 1047 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 GIFP27352 417 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ARRB2P32121 409 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 CAPZA2P47755 286 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 PPOXP50336 477 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 NME5P56597 212 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 IL1RL1Q01638 556 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 NAAAQ02083 359 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 FUT5Q11128 374 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 EFNB3Q15768 340 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 LIN52Q52LA3 116 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 AGBL2Q5U5Z8 902 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 SPATA21Q7Z572 469 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 GLCCI1Q86VQ1 547 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 LRRC34Q8IZ02 419 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ZNF781Q8N8C0 355 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 OR52P1PQ8NH57 321 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 OR52E6Q96RD3 313 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 SUCNR1Q9BXA5 334 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 PLK3Q9H4B4 646 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 USP22Q9UPT9 525 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.35□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 SH3PXD2BA1X283 911 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 B4DSR2 109 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 NR5A2O00482 541 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 BIRC5O15392 142 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ITM2AO43736 263 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 SLC43A1O75387 559 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 STAMBPO95630 424 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 GSNP06396 782 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 CHRM4P08173 479 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 TFPTP0C1Z6 253 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 CECR9P0C854 216 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 GKN3PP0CG01 181 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 IFNGR1P15260 489 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ZNF43P17038 809 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ARR3P36575 388 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 CRATP43155 626 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 SLC1A6P48664 564 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 SELENOPP49908 381 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 CRISP3P54108 245 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 TUBA1BP68363 451 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 TUBA4AP68366 448 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 BNIP2Q12982 314 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 ADIPOQQ15848 244 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 TUBA1AQ71U36 451 aa7.34□□□□□ -1.23
TROAP-208ENST00000548817 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms