RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	OR52D1	Q9H346	318 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	RASD1	Q9Y272	281 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		10.65	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	MED12L	Q86YW9	2145 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PRG6	482 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ZNHIT1	O43257	154 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	KLF4	O43474	513 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SLC19A2	O60779	497 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ALPL	P05186	524 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF43	P17038	809 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	NOS3	P29474	1203 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	AQP2	P41181	271 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	RPS6KA3	P51812	740 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ESRRG	P62508	458 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SLC36A3	Q495N2	470 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	UEVLD	Q8IX04	471 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	PARP8	Q8N3A8	854 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	RDH12	Q96NR8	316 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	IFT27	Q9BW83	186 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	INIP	Q9NRY2	104 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	EMC3	Q9P0I2	261 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF175	Q9Y473	711 aa		10.64	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ZZEF1	O43149	2961 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PNV4	684 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	PLPP3	O14495	311 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	WISP2	O76076	250 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	F13B	P05160	661 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	HSPA13	P48723	471 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	PER3	P56645	1201 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	CTXN1	P60606	82 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	OR2A2	Q6IF42	318 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SAMD8	Q96LT4	415 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF570	Q96NI8	536 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	OXGR1	Q96P68	337 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	UCN2	Q96RP3	112 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	GPA33	Q99795	319 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SLC29A1	Q99808	456 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	CALHM2	Q9HA72	323 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		10.63	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	GPR171	O14626	319 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	CYTIP	O60759	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	FZD7	O75084	574 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ACVR2A	P27037	513 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	UQCRC1	P31930	480 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SMS	P52788	366 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	CRISP1	P54107	249 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	ZP4	Q12836	540 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	NPRL3	Q12980	569 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		10.62	□□□□□ -0.71
DDB1-223	ENST00000543658	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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