RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534774.1

DDX10-208, Transcript of DEAD-box helicase 10, human

TSL 2

Gene DDX10, Length 518 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX10-208	ENST00000534774	GRPR	P30550	384 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	TMBIM6	P55061	237 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	ACTC1	P68032	377 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	ACTA1	P68133	377 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	PUDP	Q08623	228 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	PON3	Q15166	354 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	TGIF1	Q15583	401 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	SLC6A19	Q695T7	634 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	MDGA2	Q7Z553	956 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	AMER2	Q8N7J2	671 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	MDS2	Q8NDY4	140 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	RNFT2	Q96EX2	444 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	MNT	Q99583	582 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	CHST11	Q9NPF2	352 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	RASD1	Q9Y272	281 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	RNF13	O43567	381 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	GMFG	O60234	142 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	NME2P1	O60361	137 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	HPN	P05981	417 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	SP1	P08047	785 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	STS	P08842	583 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	ADORA3	P0DMS8	318 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	NME2	P22392	152 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	ATP6V1E1	P36543	226 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	NUDT6	P53370	316 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	TLE3	Q04726	772 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	FOXO1	Q12778	655 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	MYBPH	Q13203	477 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	GGTLC2	Q14390	218 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	RAB39A	Q14964	217 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	NEDD8	Q15843	81 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	OR2M7	Q8NG81	312 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	OR2T4	Q8NH00	348 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	FAR1	Q8WVX9	515 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	PTP4A1	Q93096	173 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	LGALS12	Q96DT0	336 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	COG8	Q96MW5	612 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	GNRHR2	Q96P88	292 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	DDO	Q99489	341 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	TEAD3	Q99594	435 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	AMBN	Q9NP70	447 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	PTPRB	P23467	1997 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	OR2M5	A3KFT3	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774		B4DXG7	233 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	LRRN3	E7EW58	273 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774		M0R082	166 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	MYL12B	O14950	172 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	NKX2-8	O15522	239 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	SLC34A2	O95436	690 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	IGHA1	P01876	353 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	PTN	P21246	168 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	SLC2A5	P22732	501 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	CRABP1	P29762	137 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	ERVK-25	P63136	954 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	HSF2	Q03933	536 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	CRMP1	Q14194	572 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	OR7A5	Q15622	319 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	BCL2A1	Q16548	175 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX10-208	ENST00000534774	RAET1L	Q5VY80	246 aa		11.16	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms