RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 NLRX1Q86UT6 975 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 KCNMB4Q86W47 210 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 OR4L1Q8NH43 312 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 OR10A6Q8NH74 314 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM209Q96SK2 561 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ALG8Q9BVK2 526 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 IL23AQ9NPF7 189 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 TIGARQ9NQ88 270 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 DLL4Q9NR61 685 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 DDIT4Q9NX09 232 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF221Q9UK13 617 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ASB4Q9Y574 426 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 MTCH2Q9Y6C9 303 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 KIF15Q9NS87 1388 aa6.53□□□□□ -1.36
PDCD4-211ENST00000498367 ABCB11O95342 1321 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 WDR97A6NE52 1622 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PPK0 400 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PRG6 482 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SLC22A20A6NK97 555 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TNFSF11O14788 317 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 PSTPIP1O43586 416 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 BANF1O75531 89 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TIMP1P01033 207 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR8U9P0C7N5 309 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 C1QTNF9P0C862 333 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF35P13682 527 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 IRF2P14316 349 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 IMPDH1P20839 514 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 F2RP25116 425 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SRD5A2P31213 254 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR3A3P47888 321 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CRYBA4P53673 196 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 RANP62826 216 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 C2orf80Q0P641 193 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ZP4Q12836 540 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 IRF4Q15306 451 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SPHARQ15513 63 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 UPP1Q16831 310 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM42Q69YG0 159 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 Q7L0L9 218 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR2M7Q8NG81 312 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ACER1Q8TDN7 264 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 WDR34Q96EX3 536 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 S1PR3Q99500 378 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SERPINI1Q99574 410 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SLC38A3Q99624 504 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 RAB34Q9BZG1 259 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ARL6Q9H0F7 186 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.52□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1B0GV90 55 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 FAM172BPA6NC97 362 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM202A6NGA9 273 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ZAR1LA6NP61 321 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.51□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TRDCB7Z8K6 153 aa6.51□□□□□ -1.37
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