RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495490.6

TIMM17B-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TIMM17B, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-208ENST00000495490 NPRL3Q12980 569 aa13.9□□□□□ -0.18
TIMM17B-208ENST00000495490 GSTA3Q16772 222 aa13.9□□□□□ -0.18
TIMM17B-208ENST00000495490 GPAT3Q53EU6 434 aa13.9□□□□□ -0.18
TIMM17B-208ENST00000495490 KRT80Q6KB66 452 aa13.9□□□□□ -0.18
TIMM17B-208ENST00000495490 SHISA2Q6UWI4 295 aa13.9□□□□□ -0.18
TIMM17B-208ENST00000495490 MDP1Q86V88 176 aa13.9□□□□□ -0.18
TIMM17B-208ENST00000495490 TEX29Q8N6K0 151 aa13.9□□□□□ -0.18
TIMM17B-208ENST00000495490 YIPF5Q969M3 257 aa13.9□□□□□ -0.18
TIMM17B-208ENST00000495490 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
TIMM17B-208ENST00000495490 NEURL3Q96EH8 262 aa13.9□□□□□ -0.18
TIMM17B-208ENST00000495490 MS4A5Q9H3V2 200 aa13.9□□□□□ -0.18
TIMM17B-208ENST00000495490 CRLF2Q9HC73 371 aa13.9□□□□□ -0.18
TIMM17B-208ENST00000495490 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
TIMM17B-208ENST00000495490 RASD1Q9Y272 281 aa13.9□□□□□ -0.18
TIMM17B-208ENST00000495490 NPIPB7O75200 414 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 RP2O75695 350 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 GSNP06396 782 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 CHRM4P08173 479 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 KRT4P19013 534 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 CXCR1P25024 350 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 ALDH3A1P30838 453 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 BNIP2Q12982 314 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 SYPL1Q16563 259 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 C1QL2Q7Z5L3 287 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 ANKRD46Q86W74 232 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 ANKFN1Q8N957 763 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 ZNF75AQ96N20 296 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 TAPBPLQ9BX59 468 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 SUCNR1Q9BXA5 334 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 ASIC5Q9NY37 505 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 RCE1Q9Y256 329 aa13.89□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 A8MVM7 634 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 FTCDNL1E5RQL4 147 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 NCR1O76036 304 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 ZNF35P13682 527 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 SEC24CP53992 1094 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 HPCAP84074 193 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 MYBPC1Q00872 1141 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 EMX2Q04743 252 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 CCDC36Q8IYA8 594 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 C4orf33Q8N1A6 199 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 TUBGCP3Q96CW5 907 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 SLC6A7Q99884 636 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 GPR35Q9HC97 309 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 RLIMQ9NVW2 624 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 B3GNT2Q9NY97 397 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 PRDM4Q9UKN5 801 aa13.88□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 NOTCH1P46531 2555 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 SHBGP04278 402 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 TFPTP0C1Z6 253 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 GKN3PP0CG01 181 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 HKR1P10072 659 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 UQCRBP14927 111 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 GLRXP35754 106 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 ALDH3B1P43353 468 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 CLDN17P56750 224 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 UBA52P62987 128 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 C1orf140Q5VVS0 124 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 REP15Q6BDI9 236 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 IFT20Q8IY31 132 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 KDM8Q8N371 416 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 SYT3Q9BQG1 590 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 RHOXF2Q9BQY4 288 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 MECRQ9BV79 373 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 SLC52A3Q9NQ40 469 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 B3GAT1Q9P2W7 334 aa13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 WNK1Q9H4A3 2382 aa13.86□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 A0A0G2JK05 382 aa13.86□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 CDHR4A6H8M9 788 aa13.86□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 PPIHO43447 177 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 FZD7O75084 574 aa13.86□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 PNMTP11086 282 aa13.86□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 ANPEPP15144 967 aa13.86□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 IL7RP16871 459 aa13.86□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 FOXL1Q12952 345 aa13.86□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 CASP8Q14790 479 aa13.86□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 FXNQ16595 210 aa13.86□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 TUSC1Q2TAM9 212 aa13.86□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 CEACAM16Q2WEN9 425 aa13.86□□□□□ -0.19
TIMM17B-208ENST00000495490 WBP2NLQ6ICG8 309 aa13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms