RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 IMPA2O14732 288 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 RNF13O43567 381 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 SPINK2P20155 84 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 AHCYP23526 432 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 RAB40BQ12829 278 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 NIPAL3Q6P499 406 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 FAM122BQ7Z309 247 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 SCAIQ8N9R8 606 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 SDR9C7Q8NEX9 313 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 OR2M7Q8NG81 312 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 PTP4A1Q93096 173 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 PIGQQ9BRB3 760 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 CDCA4Q9BXL8 241 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 C11orf98E9PRG8 122 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 IMPDH2P12268 514 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 SDHAP31040 664 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 CCL11P51671 97 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 RASD2Q96D21 266 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 Q96M85 177 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 OR5B2Q96R09 309 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 SCNM1Q9BWG6 230 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 INIPQ9NRY2 104 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 ALKBH4Q9NXW9 302 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXB3-210ENST00000489475 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 OR2M5A3KFT3 312 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 SERPINI2O75830 405 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 SFTPDP35247 375 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 FOXO1Q12778 655 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 KLHL12Q53G59 568 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 EMC4Q5J8M3 183 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 GPR139Q6DWJ6 353 aa24.14■■□□□ 1.45
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HOXB3-210ENST00000489475 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
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HOXB3-210ENST00000489475 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 OR52I1Q8NGK6 324 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 FCGR1BQ92637 280 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 LGALS12Q96DT0 336 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 HCAR1Q9BXC0 346 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 RNF32Q9H0A6 362 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 INMTO95050 263 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 TXNDC12O95881 172 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 OPN1LWP04000 364 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 BORAQ6PGQ7 559 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 JAZF1Q86VZ6 243 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 OR14L1PQ8NHC6 308 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 OR51V1Q9H2C8 321 aa24.13■■□□□ 1.45
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HOXB3-210ENST00000489475 CCDC160A6NGH7 325 aa24.12■■□□□ 1.45
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HOXB3-210ENST00000489475 RAB36O95755 333 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 RFPL3SP0C7P2 107 aa24.12■■□□□ 1.45
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HOXB3-210ENST00000489475 DEFB109BQ30KR1 87 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF248Q8NDW4 579 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 MDS2Q8NDY4 140 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 NMNAT3Q96T66 252 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 HES7Q9BYE0 225 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 CHST11Q9NPF2 352 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 SLC22A31A6NKX4 558 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 SEC14L2O76054 403 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 SP1P08047 785 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 GDF1P27539 372 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 DCKP27707 260 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 ATP6V1E1P36543 226 aa24.12■■□□□ 1.45
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HOXB3-210ENST00000489475 TLE3Q04726 772 aa24.12■■□□□ 1.45
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HOXB3-210ENST00000489475 TMED1Q13445 227 aa24.12■■□□□ 1.45
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HOXB3-210ENST00000489475 NPEPL1Q8NDH3 523 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 OR13F1Q8NGS4 319 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 HAS2Q92819 552 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 TSPAN32Q96QS1 320 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 B4GALT7Q9UBV7 327 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 SPTBN2O15020 2390 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 H3BSA7 217 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 TRAPPC6AO75865 159 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 CD46P15529 392 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 SHC1P29353 583 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 SLC16A1P53985 500 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 ARMC4Q5T2S8 1044 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 SLC25A25Q6KCM7 469 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-210ENST00000489475 CRELD1Q96HD1 420 aa24.11■■□□□ 1.45
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