RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
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CCL20-204ENST00000489160 APOL2Q9BQE5 337 aa3.84□□□□□ -1.79
CCL20-204ENST00000489160 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.84□□□□□ -1.79
CCL20-204ENST00000489160 RBKSQ9H477 322 aa3.84□□□□□ -1.79
CCL20-204ENST00000489160 GLIPR2Q9H4G4 154 aa3.84□□□□□ -1.79
CCL20-204ENST00000489160 FBXO44Q9H4M3 255 aa3.84□□□□□ -1.79
CCL20-204ENST00000489160 LYRM4Q9HD34 91 aa3.84□□□□□ -1.79
CCL20-204ENST00000489160 TUBG2Q9NRH3 451 aa3.84□□□□□ -1.79
CCL20-204ENST00000489160 INPP5EQ9NRR6 644 aa3.84□□□□□ -1.79
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CCL20-204ENST00000489160 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
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CCL20-204ENST00000489160 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
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CCL20-204ENST00000489160 MCOLN2Q8IZK6 566 aa3.83□□□□□ -1.8
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CCL20-204ENST00000489160 FNDC8Q8TC99 324 aa3.83□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa3.83□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 C8orf44Q96CB5 159 aa3.83□□□□□ -1.8
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CCL20-204ENST00000489160 DUSP7Q16829 419 aa3.82□□□□□ -1.8
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CCL20-204ENST00000489160 PVRIGQ6DKI7 326 aa3.82□□□□□ -1.8
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CCL20-204ENST00000489160 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.82□□□□□ -1.8
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CCL20-204ENST00000489160 SEC22AQ96IW7 307 aa3.82□□□□□ -1.8
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CCL20-204ENST00000489160 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.82□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.82□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa3.82□□□□□ -1.8
CCL20-204ENST00000489160 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP3.82□□□□□ -1.8
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