RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488985.1

RPS6KA1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, human

TSL 3

Gene RPS6KA1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA1-208	ENST00000488985	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985		Q6ZS92	163 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TRIL	Q7L0X0	811 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ZNF550	Q7Z398	422 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	KIF18B	Q86Y91	864 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SYS1	Q8N2H4	156 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985		Q8N402	240 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TMEM239	Q8WW34	195 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	THRSP	Q92748	146 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SLC35A4	Q96G79	324 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LMF1	Q96S06	567 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SDF2	Q99470	211 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	KCNJ15	Q99712	375 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	UBQLN3	Q9H347	655 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	KLHL31	Q9H511	634 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CMC2	Q9NRP2	79 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	DAPP1	Q9UN19	280 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MED31	Q9Y3C7	131 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TENM4	Q6N022	2769 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	BSN	Q9UPA5	3926 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985		A0A0G2JN53	185 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CDHR4	A6H8M9	788 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CLDN4	O14493	209 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	GPRIN2	O60269	458 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CSF3	P09919	207 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SLC35E2	P0CK97	266 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ZNF3	P17036	446 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	HK1	P19367	917 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	DRD5	P21918	477 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SLC6A6	P31641	620 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MAP3K8	P41279	467 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MC3R	P41968	323 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MAP2K3	P46734	347 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	UQCRFS1	P47985	274 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	RFX2	P48378	723 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985		Q0VFX4	171 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CDK10	Q15131	360 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LAX1	Q8IWV1	398 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SLC7A6	Q92536	515 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TSLP	Q969D9	159 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MNT	Q99583	582 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TPK1	Q9H3S4	243 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	POLE4	Q9NR33	117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985		A0A1W2PQ72	361 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	DAPL1	A0PJW8	107 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985		B4DXG7	233 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CHP2	O43745	196 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SCO2	O43819	266 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	NKX2-2	O95096	273 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	DHFR	P00374	187 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	F10	P00742	488 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	IFNA16	P05015	189 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CELA2A	P08217	269 aa		7.35	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms