RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488229.1

RPSAP4-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP4, Length 888 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP4-201ENST00000488229 E7EQL1 145 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 CLOCKO15516 846 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 FMO6PO60774 539 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 SMPD2O60906 423 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 SERPINB7O75635 380 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 C8BP07358 591 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 CD3EP07766 207 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 MPGP29372 298 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 ZNF83P51522 516 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 HIKESHIQ53FT3 197 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 ENTPD8Q5MY95 495 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 Q5PR19 223 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 FAM69AQ5T7M9 428 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 TMEM123Q8N131 208 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 OR6S1Q8NH40 331 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 RCN3Q96D15 328 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 SLC47A1Q96FL8 570 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 PERPQ96FX8 193 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 TXNDC15Q96J42 360 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 OXGR1Q96P68 337 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 TMEM43Q9BTV4 400 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 TAPBPLQ9BX59 468 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 PCDHAC1Q9H158 963 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 MED4Q9NPJ6 270 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 PARPBPQ9NWS1 579 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 EDARQ9UNE0 448 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 LAMP3Q9UQV4 416 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 RASD1Q9Y272 281 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 USF3Q68DE3 2245 aa10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 ALPK2Q86TB3 2170 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 ARID1AO14497 2285 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 CIB4A0PJX0 185 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 TRIM64A6NGJ6 449 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 TRIM64BA6NI03 449 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 ABCD4O14678 606 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 NDUFS7O75251 213 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 VAMP5O95183 116 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 CD40P25942 277 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 SEC24CP53992 1094 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 CLDN17P56750 224 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 SHEQ5VZ18 495 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 NIPAL3Q6P499 406 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 ZNF613Q6PF04 617 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 LRRC17Q8N6Y2 441 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 OR1K1Q8NGR3 316 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 OR2M2Q96R28 347 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 LINC00470Q9BZP3 86 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 MYLK2Q9H1R3 596 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 UPB1Q9UBR1 384 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa9.99□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 BBIP1A8MTZ0 92 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 PLPP3O14495 311 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 CHP2O43745 196 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 NPPAP01160 153 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 CDKN1AP38936 164 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 GYS2P54840 703 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 TBRG1Q3YBR2 411 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 PRSS57Q6UWY2 283 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 DTX2Q86UW9 622 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 NKAIN4Q8IVV8 208 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 SLC15A3Q8IY34 581 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 POMGNT2Q8NAT1 580 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 FBXW5Q969U6 566 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 MUCL1Q96DR8 90 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 Q96MF0 132 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 EMC6Q9BV81 110 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 TAS2R5Q9NYW4 299 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 SLC7A7Q9UM01 511 aa9.98□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa9.97□□□□□ -0.81
RPSAP4-201ENST00000488229 FAM220BPB1ANY3 271 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms