RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469297.1

CACNA2D1-208, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, human

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 413 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297		Q6ZRP5	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	BIVM	Q86UB2	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR10G6	Q8NH81	332 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NRGN	Q92686	78 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NTAN1	Q96AB6	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FOXC2	Q99958	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	LHX9	Q9NQ69	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NEU3	Q9UQ49	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CACNA1C	Q13936	2221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297		A0A0D9SEW6	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TNFSF12	O43508	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CALB1	P05937	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	UGT2B4	P06133	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TPM2	P07951	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FH	P07954	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RHOC	P08134	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GSTA1	P08263	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GP9	P14770	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR1E1	P30953	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KLK7	P49862	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SULT1E1	P49888	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NDST2	P52849	883 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RAG2	P55895	527 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GNA12	Q03113	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NFATC2	Q13469	925 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SYCP1	Q15431	976 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HKDC1	Q2TB90	917 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	WDR59	Q6PJI9	974 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GIPC3	Q8TF64	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	MED20	Q9H944	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SNX6	Q9UNH7	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CCL21	O00585	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	KDELR3	O43731	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	AMBP	P02760	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GZMA	P12544	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	PRG2	P13727	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SDC4	P31431	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SOX6	P35712	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	TRIM23	P36406	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	GFER	P55789	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	SRY	Q05066	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297		Q6ZS92	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNA2D1-208	ENST00000469297	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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