RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466861.1

SUMO3-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2

Gene SUMO3, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-205ENST00000466861 CASP12Q6UXS9 341 aa20.62■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 C10orf53Q8N6V4 93 aa20.62■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 POMGNT2Q8NAT1 580 aa20.62■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 C7orf34Q96L11 122 aa20.62■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 MOGAT1Q96PD6 335 aa20.62■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 MCCC2Q9HCC0 563 aa20.62■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 NANSQ9NR45 359 aa20.62■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 B3GAT1Q9P2W7 334 aa20.62■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 PRSS50Q9UI38 385 aa20.62■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 MED31Q9Y3C7 131 aa20.62■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 CENPEQ02224 2701 aa20.62■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 NQO1P15559 274 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 PMS2P3Q13401 168 aa20.61■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 AAED1Q7RTV5 226 aa20.61■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 EPHX4Q8IUS5 362 aa20.61■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 PIK3C3Q8NEB9 887 aa20.61■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 LINC01560Q8TB33 94 aa20.61■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF226Q9NYT6 803 aa20.61■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.61■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa20.61■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 MS4A18H0YCH9 400 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 PLPP3O14495 311 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 FFAR1O14842 300 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 CASKO14936 926 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 ADAP00813 363 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 HIST1H2ABP04908 130 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 TLE4Q04727 773 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 PUDPQ08623 228 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 C1DQ13901 141 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 MS4A18Q3C1V0 323 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 LCN8Q6JVE9 175 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 PXKQ7Z7A4 578 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 TMEM255BQ8WV15 326 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 HIST1H2ACQ93077 130 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 ASB9Q96DX5 294 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 MED18Q9BUE0 208 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 ASB6Q9NWX5 421 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 NDUFAF4Q9P032 175 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 ABCA4P78363 2273 aa20.6■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 A0A1W2PRQ8 180 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 A6NNC1 897 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 ENO4A6NNW6 628 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 GYG2O15488 501 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 ATP5HO75947 161 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 CH25HO95992 272 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 SEMG1P04279 462 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 ASAH2BP0C7U1 165 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 PRF1P14222 555 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 IL32P24001 234 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 RASSF2P50749 326 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 UGT2B15P54855 530 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 BNIP1Q12981 228 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 DGCR6Q14129 220 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 P2RY8Q86VZ1 359 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 UEVLDQ8IX04 471 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 MCUR1Q96AQ8 359 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 SGTBQ96EQ0 304 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 LINC00470Q9BZP3 86 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 TAS2R16Q9NYV7 291 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 SEC14L4Q9UDX3 406 aa20.59■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 ALPK2Q86TB3 2170 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 OR7A10O76100 309 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 OR6A2O95222 327 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 EDNRAP25101 427 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 YAP1P46937 504 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 SMIM11AP58511 58 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 NHLRC1Q6VVB1 395 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 DHFR2Q86XF0 187 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 UBE2J2Q8N2K1 259 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 FAM86B1Q8N7N1 296 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 ANKK1Q8NFD2 765 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 DHRS1Q96LJ7 313 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 BTBD10Q9BSF8 475 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 ACTR6Q9GZN1 396 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 IL1RAPQ9NPH3 570 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 UPB1Q9UBR1 384 aa20.58■□□□□ 0.89
SUMO3-205ENST00000466861 CELSR2Q9HCU4 2923 aa20.58■□□□□ 0.88
SUMO3-205ENST00000466861 J3KTA2 159 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms