RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	OXGR1	Q96P68	337 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	RHCG	Q9UBD6	479 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902		V9GYQ6	96 aa		15.7	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	POLQ	O75417	2590 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	CTAG2	O75638	210 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	OR6A2	O95222	327 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	MT-ATP6	P00846	226 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	HIST1H2AB	P04908	130 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	PPP3CB	P16298	524 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	AHCY	P23526	432 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	ST3GAL3	Q11203	375 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	RINL	Q6ZS11	566 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	OR6S1	Q8NH40	331 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	S100PBP	Q96BU1	408 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	PRRC1	Q96M27	445 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	ASB6	Q9NWX5	421 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	CD300A	Q9UGN4	299 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	SPG11	Q96JI7	2443 aa		15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	15.69	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	CIB4	A0PJX0	185 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902		J3KTA2	159 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	SERPINI2	O75830	405 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	THRB	P10828	461 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	IGHV1-2	P23083	117 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	CLDN17	P56750	224 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	STK11	Q15831	433 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	NIPAL3	Q6P499	406 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	UEVLD	Q8IX04	471 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	SCAI	Q8N9R8	606 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	TMEM239	Q8WW34	195 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	TMEM45B	Q96B21	275 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	NANS	Q9NR45	359 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	RASSF1	Q9NS23	344 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	C11orf98	E9PRG8	122 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	ARPC2	O15144	300 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	ADORA3	P0DMS8	318 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	T-ENOL	P0DO92	83 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	SELENOP	P49908	381 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	ZNF74	Q16587	644 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	OR5J2	Q8NH18	312 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	PFN4	Q8NHR9	129 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	MED31	Q9Y3C7	131 aa		15.67	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	MS4A18	H0YCH9	400 aa		15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	PLPP3	O14495	311 aa		15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	RAD51D	O75771	328 aa		15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	HPR	P00739	348 aa		15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	MT-ND1	P03886	318 aa		15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	THBD	P07204	575 aa		15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	CRYGS	P22914	178 aa		15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	UGT2B15	P54855	530 aa		15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	PUDP	Q08623	228 aa		15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	TRAM2	Q15035	370 aa		15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	SPATS1	Q496A3	300 aa		15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		15.66	■□□□□ 0.1
USP19-210	ENST00000465902	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		15.66	■□□□□ 0.1

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