RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa10.31□□□□□ -0.76
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PRAME-210ENST00000442481 H0YHG0 523 aa10.31□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 SULT2B1O00204 365 aa10.31□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 ARPC2O15144 300 aa10.31□□□□□ -0.76
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PRAME-210ENST00000442481 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
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PRAME-210ENST00000442481 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
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