RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 VIMP08670 466 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 CD40P25942 277 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 MPGP29372 298 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 GZMMP51124 257 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 CDH12P55289 794 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 IL1RL1Q01638 556 aa12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 FAM69AQ5T7M9 428 aa12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 OR7E24Q6IFN5 339 aa12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 SLC22A25Q6T423 547 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 TMEM108Q6UXF1 575 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 CLEC9AQ6UXN8 241 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 BIVMQ86UB2 503 aa12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 OR6T1Q8NGN1 323 aa12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 TAMM41Q96BW9 452 aa12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 MCHR1Q99705 422 aa12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 C12orf10Q9HB07 376 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 TMEM27Q9HBJ8 222 aa12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 POU2F3Q9UKI9 436 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 RASD1Q9Y272 281 aa12.12□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 A0A096LPE4 126 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PPZ6 126 aa12.11□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 CD247P20963 164 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 CRYBA2P53672 197 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 KLF10Q13118 480 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 NRF1Q16656 503 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 TBRG1Q3YBR2 411 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 METTL21CQ5VZV1 264 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 NANOGP8Q6NSW7 305 aa12.11□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 WDR88Q6ZMY6 472 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 WDFY1Q8IWB7 410 aa12.11□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 OR1K1Q8NGR3 316 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 HTRA1Q92743 480 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 SLC47A1Q96FL8 570 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 MOGAT1Q96PD6 335 aa12.11□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 SAR1AQ9NR31 198 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 AMDHD2Q9Y303 409 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 HIVEP2P31629 2446 aa12.1□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 LOC100653049A0A140TA62 436 aa12.1□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 ZNF587BE7ETH6 402 aa12.1□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa12.1□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 MRASO14807 208 aa12.1□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 FZD7O75084 574 aa12.1□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 KRT34O76011 436 aa12.1□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 SEC14L2O76054 403 aa12.1□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 PCGF2P35227 344 aa12.1□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 PHYHD1Q5SRE7 291 aa12.1□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 CARD17Q5XLA6 110 aa12.1□□□□□ -0.47
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PRAME-209ENST00000439106 C17orf78Q8N4C9 275 aa12.1□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 C10orf53Q8N6V4 93 aa12.1□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 TSPEARQ8WU66 669 aa12.1□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 RADILQ96JH8 1075 aa12.1□□□□□ -0.47
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