RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 CLDN20P56880 219 aa25.16■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 LTBQ06643 244 aa25.16■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 NSDHLQ15738 373 aa25.16■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 ZFP69Q49AA0 526 aa25.16■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 SLC35F3Q8IY50 421 aa25.16■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 SPEM1Q8N4L4 309 aa25.16■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 TRIM63Q969Q1 353 aa25.16■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 RFT1Q96AA3 541 aa25.16■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 SNX18Q96RF0 628 aa25.16■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 WACQ9BTA9 647 aa25.16■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 EPXP11678 715 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 ZP2Q05996 745 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 VWA2Q5GFL6 755 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 SNAP47Q5SQN1 464 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 ZNF684Q5T5D7 378 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 PYHIN1Q6K0P9 492 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 LYPD4Q6UWN0 246 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 OVCH1Q7RTY7 1134 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 PRSS42Q7Z5A4 293 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 KMT5CQ86Y97 462 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 SHDQ96IW2 340 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 OR14A2Q96R54 314 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 MARVELD1Q9BSK0 173 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 HDHD2Q9H0R4 259 aa25.15■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 TSPAN2O60636 221 aa25.14■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 FZD7O75084 574 aa25.14■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 TATDN3Q17R31 274 aa25.14■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 CEP78Q5JTW2 689 aa25.14■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 SLC16A9Q7RTY1 509 aa25.14■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa25.14■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa25.14■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 RTN4RQ9BZR6 473 aa25.14■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 FKRPQ9H9S5 495 aa25.14■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 NLKQ9UBE8 527 aa25.14■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 COPS7AQ9UBW8 275 aa25.14■■□□□ 1.62
CERS1-201ENST00000429504 A0A1B0GX78 115 aa25.14■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD61A6NGH8 418 aa25.14■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 ALG1L2C9J202 215 aa25.14■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 HCRTR2O43614 444 aa25.14■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 BCKDHBP21953 392 aa25.14■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 ARHGAP40Q5TG30 622 aa25.14■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 HACD4Q5VWC8 232 aa25.14■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 KLHDC3Q9BQ90 382 aa25.14■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 NRSN2Q9GZP1 204 aa25.14■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 WWTR1Q9GZV5 400 aa25.14■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 ZNF879B4DU55 563 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 ATF1P18846 271 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 SLC6A19Q695T7 634 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 OR1N1Q8NGS0 311 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 UBASH3BQ8TF42 649 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 UPRTQ96BW1 309 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 GRHPRQ9UBQ7 328 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 C4orf47A7E2U8 309 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 F13BP05160 661 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 PSMB10P40306 273 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 BCL2A1Q16548 175 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 HSD17B12Q53GQ0 312 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 GLCCI1Q86VQ1 547 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 SLC25A45Q8N413 288 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 TAAR8Q969N4 342 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 WNT16Q9UBV4 365 aa25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 SDK1Q7Z5N4 2213 aa25.12■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 A0A1W2PPK0 400 aa25.12■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 SLC43A1O75387 559 aa25.12■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 PLCXD2Q0VAA5 305 aa25.12■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 GPR139Q6DWJ6 353 aa25.12■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 SLC29A4Q7RTT9 530 aa25.12■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 ZNF511Q8NB15 262 aa25.12■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 CAPSLQ8WWF8 208 aa25.12■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 VN1R1Q9GZP7 353 aa25.12■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 A0A1B0GVT2 93 aa25.11■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 CDC14CA4D256 554 aa25.11■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 OR6C76A6NM76 312 aa25.11■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 CENPXA8MT69 81 aa25.11■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 A8MV72 311 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 NDUFB5O43674 189 aa25.11■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 HIST1H2ABP04908 130 aa25.11■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 TFPIP10646 304 aa25.11■■□□□ 1.61
CERS1-201ENST00000429504 IFITM2Q01629 132 aa25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms