RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368567.4

RPS27-201, Transcript of ribosomal protein S27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS27, Length 350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27-201ENST00000368567 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 ADAM12O43184 909 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 ENTPD5O75356 428 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 AKAP3O75969 853 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 ADCY5O95622 1261 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 HBQ1P09105 142 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 UROSP10746 265 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 TDGF1P13385 188 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 WARSP23381 471 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 BDNFP23560 247 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 CMA1P23946 247 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 PTGDSP41222 190 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 TNFSF9P41273 254 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 HTR5AP47898 357 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 UBE2AP49459 152 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 CCL11P51671 97 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 TDGF1P3P51864 188 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 SELENOTP62341 195 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 RPL8P62917 257 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 CACNG7P62955 275 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 NTHL1P78549 312 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 RIPK1Q13546 671 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 GNMTQ14749 295 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 SPCS2Q15005 226 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 NDUFA9Q16795 377 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 HFEQ30201 348 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 FAM74A3Q4VXF1 159 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 AGKQ53H12 422 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 ARMC3Q5W041 872 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 ZNF562Q6V9R5 426 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 SPNS3Q6ZMD2 512 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 Q6ZR03 302 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 ZNF621Q6ZSS3 439 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 TMEM26Q6ZUK4 368 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 PAQR9Q6ZVX9 377 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 C12orf56Q8IXR9 622 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 CCDC36Q8IYA8 594 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 OR8H3Q8N146 312 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 LINC01561Q8N1V8 128 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 LRRC17Q8N6Y2 441 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 C15orf54Q8N8G6 183 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 Q8N976 141 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 LINC00304Q8N9R0 145 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 CNNM3Q8NE01 707 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 STKLD1Q8NE28 680 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 NPBQ8NG41 125 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 SYNPRQ8TBG9 265 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 M1APQ8TC57 530 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 PAQR8Q8TEZ7 354 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 PHYHIPQ92561 330 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 ASB9Q96DX5 294 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 SDSLQ96GA7 329 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 OR5B2Q96R09 309 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 CYP2S1Q96SQ9 504 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 DOK1Q99704 481 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 CCT7Q99832 543 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 FOXC2Q99958 501 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 CITED1Q99966 193 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 DESI2Q9BSY9 194 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 TMEM121Q9BTD3 319 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 SLC5A7Q9GZV3 580 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 LINC00597Q9H2U6 94 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 VCPKMTQ9H867 229 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 LPAR2Q9HBW0 351 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 PIGVQ9NUD9 493 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 TREM2Q9NZC2 230 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 AIPL1Q9NZN9 384 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 FAM153AQ9UHL3 310 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 CYTH4Q9UIA0 394 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 RIMS3Q9UJD0 308 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 GNPTGQ9UJJ9 305 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 FBXW2Q9UKT8 454 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 RNF6Q9Y252 685 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 TRAPPC4Q9Y296 219 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 PHIPQ8WWQ0 1821 aa0.35□□□□□ -2.35
RPS27-201ENST00000368567 MYO5BQ9ULV0 1848 aa0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms