RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 SERPIND1P05546 499 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPIAL4FP0DN26 164 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 ABOP16442 354 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 FUT3P21217 361 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP5OP48047 213 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRRX1P54821 245 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRPS1P60891 318 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 BST2Q10589 180 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 ILKQ13418 452 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 UNC119Q13432 240 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARL6IP1Q15041 203 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 C1orf100Q5SVJ3 147 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 C1orf185Q5T7R7 199 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARMC12Q5T9G4 340 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPR157Q5UAW9 335 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRRC66Q68CR7 880 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 CTRB2Q6GPI1 263 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 SASS6Q6UVJ0 657 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 TFAP2EQ6VUC0 442 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q6ZR54 194 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNM1P46Q6ZS02 220 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPP1R27Q86WC6 154 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 NUDCD3Q8IVD9 361 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF100Q8IYN0 542 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 TTC5Q8N0Z6 440 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZFP41Q8N8Y5 198 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 C20orf203Q8NBC4 194 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC148Q8NFR7 591 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC2A14Q8TDB8 520 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR1E3Q8WZA6 343 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 RASD2Q96D21 266 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 MED8Q96G25 268 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 TPD52L3Q96J77 140 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR8B4Q96RC9 309 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 EBF4Q9BQW3 602 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAIM2Q9BWQ8 316 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM59Q9BXS4 323 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 HES7Q9BYE0 225 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM192AQ9GZU8 254 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 EHD1Q9H4M9 534 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 VPS37BQ9H9H4 285 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 LY9Q9HBG7 655 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 NT5MQ9NPB1 228 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 AIG1Q9NVV5 245 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 QPCTLQ9NXS2 382 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPATA7Q9P0W8 599 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMCO1Q9UM00 188 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 MMP24Q9Y5R2 645 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSMB11A5LHX3 300 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMCO2A6NFE2 343 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 C12orf77C9JDV5 145 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 HDAC3O15379 428 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPIPB7O75200 414 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGKV3-15P01624 115 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 FGGP02679 453 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 GIPP09681 153 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGKV1-13P0DP09 117 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 FOLR1P15328 257 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF43P17038 809 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD1BP29016 333 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 BTDP43251 543 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 GYG1P46976 350 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 GNB2P62879 340 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 TGFBIQ15582 683 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 PARP15Q460N3 678 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 XKR7Q5GH72 579 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 MARCH8Q5T0T0 291 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 LCN12Q6JVE5 192 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRIM40Q6P9F5 258 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 CNIH2Q6PI25 160 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM107Q6UX40 140 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 PAQR7Q86WK9 346 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 MS4A15Q8N5U1 240 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR2AP1Q8NGE2 309 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR1S2Q8NGQ3 325 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACER1Q8TDN7 264 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMARCD2Q92925 531 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-487P-201ENST00000365430 SEC22AQ96IW7 307 aa1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms