RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 CBLL1Q75N03 491 aa23.77■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM255BQ8WV15 326 aa23.77■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa23.77■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 PARPBPQ9NWS1 579 aa23.77■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 ADAM21Q9UKJ8 722 aa23.77■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa23.77■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa23.77■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 MS4A18H0YCH9 400 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 UGT2B15P54855 530 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 CLDN17P56750 224 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF74Q16587 644 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 MS4A18Q3C1V0 323 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 NIPAL3Q6P499 406 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 LINGO2Q7L985 606 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 WDFY1Q8IWB7 410 aa23.76■■□□□ 1.39
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TPGS1-201ENST00000359315 CCDC197Q8NCU1 140 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 PFN4Q8NHR9 129 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 FAM162AQ96A26 154 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 MPP4Q96JB8 637 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 HSH2DQ96JZ2 352 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 OXGR1Q96P68 337 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 RIMS3Q9UJD0 308 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 A4GNTQ9UNA3 340 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa23.76■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 J3KTA2 159 aa23.75■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 NDUFAB1O14561 156 aa23.75■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 OR5F1O95221 314 aa23.75■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 CH25HO95992 272 aa23.75■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 NQO1P15559 274 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF43P17038 809 aa23.75■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC17Q8N6Y2 441 aa23.75■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa23.75■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 ASPNQ9BXN1 380 aa23.75■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 TAS2R16Q9NYV7 291 aa23.75■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 UPB1Q9UBR1 384 aa23.75■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 CORINQ9Y5Q5 1042 aa23.75■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1W2PR80 420 aa23.74■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 UPK3AO75631 287 aa23.74■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 PLAUP00749 431 aa23.74■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
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TPGS1-201ENST00000359315 IL1RL1Q01638 556 aa23.74■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 PMS2P3Q13401 168 aa23.74■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 MFSD13AQ14CX5 517 aa23.74■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 BEX5Q5H9J7 111 aa23.74■■□□□ 1.39
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TPGS1-201ENST00000359315 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa23.74■■□□□ 1.39
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TPGS1-201ENST00000359315 FAM86B1Q8N7N1 296 aa23.74■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 SCAIQ8N9R8 606 aa23.74■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 LZICQ8WZA0 190 aa23.74■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 PLPPR2Q96GM1 343 aa23.74■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 PRRC1Q96M27 445 aa23.74■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 RHCGQ9UBD6 479 aa23.74■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa23.74■■□□□ 1.39
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TPGS1-201ENST00000359315 PLPP3O14495 311 aa23.73■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF432O94892 652 aa23.73■■□□□ 1.39
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TPGS1-201ENST00000359315 KRT72Q14CN4 511 aa23.73■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 GABRA6Q16445 453 aa23.73■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 IFI44LQ53G44 452 aa23.73■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 GLYATQ6IB77 296 aa23.73■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 PAMR1Q6UXH9 720 aa23.73■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 C20orf141Q9NUB4 165 aa23.73■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 NPAP1Q9NZP6 1156 aa23.73■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 CIB4A0PJX0 185 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 OR5H1A6NKK0 313 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 FFAR1O14842 300 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 PIP5K1CO60331 668 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 MT-ATP6P00846 226 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 IST1P53990 364 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 DEFB107AQ8IZN7 70 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 OR5J2Q8NH18 312 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 OR52N5Q8NH56 324 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 HSD17B8Q92506 261 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 TXNDC15Q96J42 360 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 CDRT15Q96T59 188 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 SLC19A3Q9BZV2 496 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 MED29Q9NX70 200 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 CD300AQ9UGN4 299 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 RCE1Q9Y256 329 aa23.72■■□□□ 1.39
TPGS1-201ENST00000359315 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa23.71■■□□□ 1.39
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