RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TSLPQ969D9 159 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MIB2Q96AX9 1013 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RHOFQ9HBH0 211 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TMED3Q9Y3Q3 217 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LNP1A1A4G5 178 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GFRA2O00451 464 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CSTAP01040 98 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GP1BAP07359 652 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GUSBP08236 651 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CEBPBP17676 345 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 NTSR1P30989 418 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SLC5A2P31639 672 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MEP1BQ16820 701 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 DCST2Q5T1A1 773 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR52W1Q6IF63 320 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 BTNL8Q6UX41 500 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RNF111Q6ZNA4 994 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 F2RL3Q96RI0 385 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PDE7BQ9NP56 450 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MYO9BQ13459 2157 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 FIGNL2A6NMB9 653 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 ACVR1Q04771 509 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SHHQ15465 462 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 OR7D4Q8NG98 312 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 TIMM22Q9Y584 194 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 SERPINE3A8MV23 424 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H3AP68431 136 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 TREML1Q86YW5 311 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 C16orf78Q8WTQ4 265 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 OPN1MWP04001 364 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRD-201ENST00000355233 CA3P07451 260 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ADORA3P0DMS8 318 aa4.57□□□□□ -1.68
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