RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 ATP4BP51164 291 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TPTEP56180 551 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CDC42P60953 191 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MVKQ03426 396 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SLC3A1Q07837 685 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 DAG1Q14118 895 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 DESI1Q6ICB0 168 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 OR10H4Q8NGA5 316 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF417Q8TAU3 575 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SLC35A4Q96G79 324 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF570Q96NI8 536 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SLITRK2Q9H156 845 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SLC26A1Q9H2B4 701 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SERHL2Q9H4I8 314 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SCN3BQ9NY72 215 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RIMS3Q9UJD0 308 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SLC7A11Q9UPY5 501 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GPR45Q9Y5Y3 372 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 C12orf71A8MTZ7 269 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ADAMDEC1O15204 470 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 LGI1O95970 557 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 APOC1P02654 83 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CSTBP04080 98 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF3P17036 446 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFB7P17568 137 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FPR2P25090 351 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CDKN1AP38936 164 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 POU3F4P49335 361 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CLDN20P56880 219 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SLC37A1P57057 533 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ERVK-25P63136 954 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ARF1P84077 181 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MZT1Q08AG7 82 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 Q0VFX4 171 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RABL3Q5HYI8 236 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FAM69AQ5T7M9 428 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf40Q8IXQ3 194 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 FAM222BQ8WU58 562 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CLPTM1LQ96KA5 538 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SFXN3Q9BWM7 321 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TTTY10Q9BZA0 68 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TPK1Q9H3S4 243 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC7A7Q9UM01 511 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 PCM1Q15154 2024 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 COL6A3P12111 3177 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GVI7 797 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 H7C1Q1 480 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 MFN2O95140 757 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ITGA5P08648 1049 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 B4GALT1P15291 398 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 GRK5P34947 590 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SOX18P35713 384 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RAB1AP62820 205 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA46Q5T0L3 261 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PLXDC2Q6UX71 529 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 NRMQ8IXM6 262 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf87Q8N0U7 546 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 OR1J1Q8NGS3 322 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 SETD6Q8TBK2 473 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 TEX37Q96LM6 180 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TECTBQ96PL2 329 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 STACQ99469 402 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 SYT3Q9BQG1 590 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 BCL2L14Q9BZR8 327 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 PIGMQ9H3S5 423 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 C15orf41Q9Y2V0 281 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GWA3 101 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PPE2 198 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PR64 198 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PRV1 198 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 A6NIZ1 184 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RNF212BA8MTL3 300 aa4□□□□□ -1.77
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