RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324545.8

USP9X-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 9 X-linked, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP9X, Length 12,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9X-201ENST00000324545 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 TULP4Q9NRJ4 1543 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 A0A1W2PNV4 684 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 BMPR1BO00238 502 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 GPR37O15354 613 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 BMPR1AP36894 532 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 FBXO43Q4G163 708 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 H0YAE9 185 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 FUT1P19526 365 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 CD70P32970 193 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 TRAM1Q15629 374 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 VRK2Q86Y07 508 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 HAPLN3Q96S86 360 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 IGKV3-11P04433 115 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 RHOBP62745 196 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ADPRMQ3LIE5 342 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 UGT3A2Q3SY77 523 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SLC22A25Q6T423 547 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 IRF7Q92985 503 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 S1PR3Q99500 378 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SCML1Q9UN30 329 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 NWD1Q149M9 1564 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 CEBPBP17676 345 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SNCAP37840 140 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 PSMB2P49721 201 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 HSF1Q00613 529 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ASB13Q8WXK3 278 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 NT5C3BQ969T7 300 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.99□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ZNF785A8K8V0 405 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 UBL4AP11441 157 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 CYBAP13498 195 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 DDCP20711 480 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 DSC1Q08554 894 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 NAGSQ8N159 534 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 GLTPQ9NZD2 209 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 NUDT19A8MXV4 375 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 AKAIN1P0CW23 69 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 RBPJQ06330 500 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 MEP1BQ16820 701 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SLC35G3Q8N808 338 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 C20orf202A1L168 122 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 GGT1P19440 569 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 NDUFS1P28331 727 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 PDCD1Q15116 288 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 THEM4Q5T1C6 240 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 PXDNQ92626 1479 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 GBF1Q92538 1859 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 MFSD5Q6N075 450 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 FAM3CQ92520 227 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 WDR92Q96MX6 357 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 C7orf26Q96N11 449 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 A0A1W2PNR3 127 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 PKDCCQ504Y2 493 aa6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP9X-201ENST00000324545 SLC5A8Q8N695 610 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms